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Forzzainter

新虫 (初入文坛)

[交流] 同源重组连载体,长得菌摇不起来,大神们知道怎么回事么?

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本人最近在做同源重组连接,将2-3个片段连接到载体上。
连接酶用的是擎科sosoo同源重组连接酶;载体用的是pBI121载体,长度14758bp。
插入的片段大小1100bp左右;酶切位点用的BamH I单酶切,同源臂是擎科的技术给我设计的应该没问题。
载体用TAKARA的快切酶,确认酶切开。
连接时摩尔比按两种形式进行计算。1载体:片段=1:10;2载体:总片段=1:10(即插入两个片段时摩尔比为1:5:5;插入三个片段时摩尔比为1:3:3:3)。
热激法转入感受态,涂板过夜培养12-16h。第二天版上有长菌,但是挑出来的菌都摇不起来,不知是什么原因。
做过pBI121空载的对照,证明感受态,平板以及含抗生素的LB液体都没问题。也排除噬菌体干扰。
有怀疑过是不是因为载体太长的缘故,但还是不太明白明明版上的菌长得很好,为什么摇不起来。按理说同源重组应该长出来的都是阳性菌株,跪求大神解惑。
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腐草为萤8

金虫 (著名写手)

cat


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同学之前也遇到过,重新转化之后好了~

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实验,美食
2楼2020-07-25 22:09:42
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Forzzainter

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 腐草为萤8 at 2020-07-25 22:09:42
同学之前也遇到过,重新转化之后好了~

重转化了,但还是不行。

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3楼2020-07-26 00:01:49
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腐草为萤8

金虫 (著名写手)

cat


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把lb重新配一个吧,我记得当时,我帮同学先挑了一批,很小很小的时候挑的,摇菌长起来了,后来长大一点后,再挑的,就都没长起来,具体是因为什么就不太清楚了

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实验,美食
4楼2020-07-26 07:53:00
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狗狗狗尾巴草

金虫 (小有名气)


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平板上长出来的菌落有没有试着做菌落PCR,验证片段是否连接成功?
5楼2020-07-26 10:29:08
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Forzzainter

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 狗狗狗尾巴草 at 2020-07-26 10:29:08
平板上长出来的菌落有没有试着做菌落PCR,验证片段是否连接成功?

菌落pcr有做,但是做出来的条带和预期的差一些,而且也摇不起来。

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6楼2020-07-26 21:20:07
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Forzzainter

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 腐草为萤8 at 2020-07-26 07:53:00
把lb重新配一个吧,我记得当时,我帮同学先挑了一批,很小很小的时候挑的,摇菌长起来了,后来长大一点后,再挑的,就都没长起来,具体是因为什么就不太清楚了

重连了也摇不起来,lb也重新配了。已经打算换载体了

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7楼2020-07-26 21:21:10
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狗狗狗尾巴草

金虫 (小有名气)


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引用回帖:
6楼: Originally posted by Forzzainter at 2020-07-26 21:20:07
菌落pcr有做,但是做出来的条带和预期的差一些,而且也摇不起来。
...

从头验证下引物,模板,酶切位点等是不是有问题吧,建议重新连接。
8楼2020-07-27 08:55:21
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Forzzainter

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 狗狗狗尾巴草 at 2020-07-27 08:55:21
从头验证下引物,模板,酶切位点等是不是有问题吧,建议重新连接。...

嗯,好的谢谢。已经换载体重新连了。

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9楼2020-07-27 17:14:15
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