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zhumenjun

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】分子表面静电势的计算

最近想要计算分子表面静电势,看了一些文献,但不知道怎么计算及计算后out文件的分析,想向各位请教一下:
1.计算时使用的关键词是什么?文献中提到:用Gaussian 98W对各个分子进行HF/ 6-31G*
水平上的进一步优化,并在优化结构基础上,进行静电势的计算. 静电势的计算采用格点法,立方格精度设定为Cube = 100. 这样对每个分子而言,可获得近1003 个点的静电势. 然后,对这些点的静电势进行统计计算以获取所需的参数.
2.怎么在out文件中提取静电势的信息?想要求这几个静电势:Vmin和Vs ,min ,分别表示分子空间内和分子表面上最负的静电势; ΣV+s 和ΣV-s ,分子表面正的静电势和负的静电势求和,表面静电势的平衡参数(ν).
希望多多指点,先谢谢了
相关文献:基于分子表面静电势参数研究多环芳烃化合物的定量结构- 性质关系:http://d.namipan.com/d/de34412e0 ... 98514477a0ca5e30400

[ Last edited by zhumenjun on 2009-7-14 at 15:34 ]
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zlding

木虫 (著名写手)

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lei0736(金币+5,VIP+0):谢谢 一堆木虫啊 7-15 20:14

zhou2009

版主 (著名写手)

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lei0736(金币+6,VIP+0):谢谢 7-16 10:30

yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

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lei0736(金币+5,VIP+0):谢谢 7-16 15:26

zhou2009

版主 (著名写手)

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lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢 7-17 09:30
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