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al597032982

铁虫 (初入文坛)

[求助] 点突变求助,求问关于大肠杆菌对线性质粒的修复过程 已有1人参与

各位大佬请问一下我把环P后的突变质粒用DpnI消化后胶回收纯化,然后直接转化到大肠杆菌中,但是测序的时候发现在P出的两个末端之间插入了整数个引物的序列,一般在十个左右,按理说应该已经除掉引物和模板碎片了,不知道为什么还会有这种情况。
PCR的引物一开始用的是反向互补的,插入现象很严重,几乎所有阳性克隆都有插入片段;后来改用不完全互补的引物之后,稍微好了点但是也有个别的出现了插入,这样看应该也不是PCR引入的啊。
另外想请问一下大肠杆菌的连接酶的工作原理,是连接任意平末端么。
谢谢大佬们
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雨独步

铁杆木虫 (著名写手)

能说一下你做这个实验的目的是什么吗?是要在质粒上基因中引入点突变?
2楼2020-06-03 18:57:07
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小汰宝

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
是不是引物出现了我P我自己现象...(没有理论依据,我瞎猜的)

我也遇到过这个情况,当时选择无视..反正最后只要找到一个正确克隆的点就可以了。你是做定点突变是么?

长出点了以后批量菌落pcr,把大小正确的送测,选中正确克隆的几率会高些
3楼2020-06-06 09:51:39
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