24小时热门版块排行榜    

查看: 7537  |  回复: 15

渔人图图

新虫 (小有名气)

[求助] 求教!急!qPCR内参Ct值高至35!但之前同样的手法都能跑出来Ct18-19! 已有1人参与

最近提取小鼠肝细胞AML12的RNA 进行逆转,之后荧光实时PCR。在居家办公之前,内参MPPIA的Ct值有18-19左右,target gene大概26-28左右,都有比较好的扩增曲线和溶解曲线。但是自复工以来,同样提取得到的RNA,逆转之后跑实时PCR,内参MPPIA的Ct值都已经33以上,甚至高于35,或压根undetermined;target gene全部都是undetermined,溶解曲线根本不规则。

同样的手法,同样的Trizol提取方式,实在不知道是怎么回事了。目前出现这种情况已经三次,用别人的RNA sample可以跑出内参及target gene。所以怀疑是RNA样品出问题,但是今天又一次仔仔细细用Trizol提取RNA,包括*头重新灭菌,所用试剂全部换新的,再三确定无误,结果依旧不行,内参已经30好几,target gene依然undetermined。注:RNA浓度有300ng/ul左右(溶于20ulDEPC),260/280有1.8左右。

已经3次了。。同实验室的前辈也不知道是什么原因导致。。希望大神们能指点一二啊!拜谢!@biostar2009@biostar2009@wizardfan@飞约疯人院
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

owl2010

金虫 (正式写手)

★ ★ ★
西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2020-05-11 07:59:21
两个方面:反转录试剂可或者做定量的试剂不行了。检查一下提取的RNA样本跑一下胶,没问题的话自己再跑一下普通pcr,用actin引物试试你新反转录的cDNA,跑胶看看,啥都没有说明反转录不成功,换反转录试剂吧,如果cDNA没问题,换跑定量的试剂。
男人的组成要素:金钱、面子、性、怕死、自恋、吹牛逼。
4楼2020-05-09 14:25:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

owl2010

金虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 渔人图图 at 2020-05-09 19:17:59
好的 谢谢您!今天又提了一次RNA 等下qPCR 同时还拿了别人的RNA样品 从逆转开始 再一起qPCR 看结果了 如果别人的正常 我的不正常 那就是RNA问题了。。...

为什么提取的RNA不先跑一下胶看看呢?万一降解了后续都不用做了。
男人的组成要素:金钱、面子、性、怕死、自恋、吹牛逼。
7楼2020-05-09 19:36:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

Crescendo

铁杆木虫 (著名写手)


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2020-05-11 07:59:09
这种情况下,考虑换定量试剂

发自小木虫Android客户端
日拱一卒,功不唐捐
2楼2020-05-09 07:51:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

渔人图图

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by Crescendo at 2020-05-09 07:51:34
这种情况下,考虑换定量试剂

您好 请问定量试剂是指?

发自小木虫IOS客户端
3楼2020-05-09 13:09:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pennchem

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
试剂放久了,性能下降了?
行至水穷处,坐看云起时
5楼2020-05-09 15:05:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

渔人图图

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by owl2010 at 2020-05-09 14:25:50
两个方面:反转录试剂可或者做定量的试剂不行了。检查一下提取的RNA样本跑一下胶,没问题的话自己再跑一下普通pcr,用actin引物试试你新反转录的cDNA,跑胶看看,啥都没有说明反转录不成功,换反转录试剂吧,如果cD ...

好的 谢谢您!今天又提了一次RNA 等下qPCR 同时还拿了别人的RNA样品 从逆转开始 再一起qPCR 看结果了 如果别人的正常 我的不正常 那就是RNA问题了。。
6楼2020-05-09 19:17:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

渔人图图

新虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by owl2010 at 2020-05-09 19:36:21
为什么提取的RNA不先跑一下胶看看呢?万一降解了后续都不用做了。...

主要是不太相信是降解 我之前都这样提 别人也是这样 所以还是抱有侥幸 今天先再试一次 如果还是不好 再去跑胶吧 真降解的话 这降解的原因也蒙圈 因为枪头试剂已经全部换了
8楼2020-05-09 20:57:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

QBLiqibing

金虫 (正式写手)


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2020-05-11 07:59:44
若你的基因本来丰度比较低,可以考虑环境条件,你实验时周围是否还有其他操作质粒等实验
9楼2020-05-10 11:32:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

渔人图图

新虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by QBLiqibing at 2020-05-10 11:32:32
若你的基因本来丰度比较低,可以考虑环境条件,你实验时周围是否还有其他操作质粒等实验

没有。今天等会跑胶,看结果吧。
10楼2020-05-10 18:16:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 渔人图图 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[文学芳草园] 梦想 +5 myrtle 2026-08-26 8/400 2026-09-02 02:42 by Leogzhya
[基金申请] 学科评审组评审是指会评吗? +4 瞬息宇宙 2026-08-31 4/200 2026-09-01 14:58 by jiaoxg
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高,自己申请怎么就这么难 +13 Kittylucky 2026-08-27 14/700 2026-09-01 11:06 by feng6531
[基金申请] 国社科又开始会评了,不知道这次命运如何 +7 雨打竹帘 2026-08-30 11/550 2026-08-31 23:16 by hittle2008
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +6 yuleib84 2026-08-26 7/350 2026-08-31 19:46 by 鱼翔浅底1
[基金申请] 面上意见出来了 +12 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 23/1150 2026-08-31 18:57 by 黄鸟于飞Chao
[基金申请] 能否申诉? +7 echo8914667 2026-08-30 8/400 2026-08-31 17:00 by yihongxu
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗? +7 349506619 2026-08-28 7/350 2026-08-31 13:39 by 冼亮淀粉酶
[基金申请] 29号明天会评吗 +4 笨笨唐 2026-08-28 4/200 2026-08-31 09:30 by huixian257
[基金申请] 基金不中,共勉 +12 eulota 2026-08-26 12/600 2026-08-31 08:42 by ZJTJZ
[基金申请] 为什么到现在没收到通知? +5 tannykie 2026-08-29 5/250 2026-08-30 21:05 by purplejack
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已,这评审意见是按照杰青的条件评的吧? +6 gouxfjh 2026-08-28 11/550 2026-08-30 07:57 by gouxfjh
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 牛来!米来!面来! +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
信息提示
请填处理意见