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DNA解旋酶与DNA的结合检测(gel-PAGE与EMSA结果矛盾)
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scxryu
木虫
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虫号: 1499267
[交流]
DNA解旋酶与DNA的结合检测(gel-PAGE与EMSA结果矛盾)
请问有人做过DNA解旋酶和DNA结合相关的实验吗?
我最近将DNA解旋酶和单链DNA孵育后,用琼脂糖凝胶电泳检测,确实是有结合的:结合后的有条带,与对照组的单链DNA条件相差大约100bp大小,区分度很好。
但是用EMSA跑胶,只有单链DNA的条带,却没有结合的条带,请问可能是什么原因?(染蛋白也是没有条带的)
EMSA用的试剂为thermo Fisher购买的Electrophoretic Mobility Shift Assay (EMSA) Kit (E33075);即用sybr green染的DNA,用SYPRO染的蛋白。我的配胶是用的6%的非变性胶,实验过程该试剂盒参照说明书进行。
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1楼
2020-03-18 15:09:17
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scxryu
木虫
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虫号: 1499267
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11楼
:
Originally posted by
pennchem
at 2020-03-19 08:36:17
琼脂糖和PAGE的孔径不一样?
Helicase有单条肽的,但是很多replicative的helicase是hexamer,可能分子量太大,跑不进去?
是的,孔径肯定是琼脂糖的大一些。这个问题我也在考虑
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13楼
2020-03-20 14:44:18
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pennchem
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★
scxryu(金币+1): 谢谢参与
琼脂糖和PAGE的孔径不一样?
Helicase有单条肽的,但是很多replicative的helicase是hexamer,可能分子量太大,跑不进去?
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scxryu
11楼
2020-03-19 08:36:17
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danghaha
3楼
2020-03-18 17:37
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scxryu(金币+1): 谢谢参与
发自小木虫IOS客户端
hbabc
4楼
2020-03-18 17:54
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scxryu(金币+1): 谢谢参与
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08022215
6楼
2020-03-18 20:11
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scxryu(金币+1): 谢谢参与
好
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