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xiongzq9788

新虫 (正式写手)

[交流] 请教:PLAT780 Type_1 Test whether coordinates form a connected set 已有2人参与

解一个晶体,出现一个Alert level A (如题)
  Atoms given in a CIF should form a 'connected set', i.e. no symmetry
operations are needed to get atoms in a bonding position. A connected set of
atoms is not needed for the least squares refinement (unless hydrogen atoms
are to be added at calculated positions). Geometry listings (bonds, angles,
torsions & H-bonds) become unwieldy for non-connected atom sets.
初次碰到此问题,请教虫友们,什么原因,怎么解决?谢谢!
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xiongzq9788

新虫 (正式写手)

自个顶一下!
2楼2009-06-19 15:40:08
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xglegl

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
xiongzq9788(金币+2,VIP+0):谢谢!反复检查了结构,应该没有问题!是不是对称操作等问题。。。 6-19 16:47
paopaomeng(金币+1,VIP+0):谢谢交流 6-19 19:26
你结构中有不正确的连接 你看看结构对吗?
3楼2009-06-19 16:20:50
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xiongzq9788

新虫 (正式写手)

又碰到一A问题:PLAT601_ALERT_2_A Structure Contains Solvent Accessible VOIDS of .     296.00 A**3
这是什么意思呀!(溶剂的体积达到296,不明白)
4楼2009-06-19 16:50:24
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xglegl

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
xiongzq9788(金币+2,VIP+0):谢谢了! 6-20 08:53
paopaomeng(金币+1,VIP+0):谢谢交流 6-20 16:22
这是你的结构中还有大的Q峰,就是说你的结构中还有溶剂没有定下来
5楼2009-06-20 08:40:39
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xglegl

木虫 (正式写手)

★
paopaomeng(金币+1,VIP+0):谢谢交流 6-21 12:05
你的结构中肯定还有溶剂分子没有找到 所以就存在这个提示 你的看看还有大的Q峰没有认定吗?
6楼2009-06-21 08:51:00
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xiongzq9788

新虫 (正式写手)

我发现不加H则没有780,一旦理论加H后就有这个问题,不知何故?
7楼2010-06-17 21:39:25
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wujinji

金虫 (正式写手)

xiongzq9788(金币+1): 2010-06-18 09:52:36
重新解吧,应该还有些别的元素,整个结构框架应该是错的。
8楼2010-06-17 21:53:09
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