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xujc1983

木虫 (著名写手)


[资源] 【原创】通过CASTEP产生POSCAR文件【已搜索“CASTEP”+“POSCAR”,无重复】

前几天回帖说过自己产生POSCAR文件是通过CASTEP完成的,具体过程如下:
1.  在CASTEP中把模型建好。
2.  模块中的CASTEP,计算,单击“Run”旁边的“Files...”按钮,然后点击“Save Files”按钮,弹出对话框,选“No”,将相关文件保存到project中,会出现类似计算出现的下一级文件夹。
3.  从电脑中找到此文件夹,找到***.cell文件。此文件为隐藏文件,***为MS中模型的名字。有用的为前几行,以BCC-Fe单胞为例,产生的Fe.cell文件开头内容如下:
%BLOCK LATTICE_CART
       2.866400000000000       0.000000000000000       0.000000000000000
       0.000000000000000       2.866400000000000       0.000000000000000
       0.000000000000000       0.000000000000000       2.866400000000000
%ENDBLOCK LATTICE_CART

%BLOCK POSITIONS_FRAC
Fe   0.0000000000000000   0.0000000000000000   0.0000000000000000
Fe   0.5000000000000000   0.5000000000000001   0.5000000000000001
%ENDBLOCK POSITIONS_FRAC
......
4.  书写POSCAR文件。
第一行,自定义体系名,随便自己写了,以自己方便为好
第2-5行为晶格缩放因子(晶格常数)和晶格矢量,可以有两种写法
第一种:
1.0000
     2.866400000000000       0.000000000000000       0.000000000000000
     0.000000000000000       2.866400000000000       0.000000000000000
     0.000000000000000       0.000000000000000       2.866400000000000
第二种:
2.866400001.0000
     1.000000000000000       0.000000000000000       0.000000000000000
     0.000000000000000       1.000000000000000       0.000000000000000
     0.000000000000000       0.000000000000000       1.000000000000000
推荐第二种写法
第6行,原子数目。应该按照种类分别写,后面坐标以及POTCAR中的顺序应与此处相同。
第7行,给出的坐标类型。“cartesian”和“direct”之分,分别是笛卡尔坐标和分数坐标,通常用第2中,分数坐标。
第8行及其以后,按照第6行原子种类排序的各个原子的分数坐标。
注:如果要考虑,部分坐标驰豫的话,需要在第7行前加入一行,“Selective dynamics”,并在各个原子坐标后,以“T”,“F”标记那个坐标需要驰豫
BCC-Fe产生POSCAR如下,具体书写格式可参考VASP Guide
BCC-Fe                                 
    2.866400000000000     
     1.0000000000000000    0.0000000000000000    0.0000000000000000
     0.0000000000000000    1.0000000000000000    0.0000000000000000
     0.0000000000000000    0.0000000000000000    1.0000000000000000
   2
Direct
  0.0000000000000000  0.0000000000000000  0.0000000000000000
  0.5000000000000000  0.5000000000000000  0.5000000000000000

[ Last edited by xujc1983 on 2009-6-9 at 19:40 ]
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xujc1983

木虫 (著名写手)


★ ★
qasd(金币+2,VIP+0):xiexie~ 9-9 13:43
引用回帖:
Originally posted by xiaojie7783 at 2009-6-11 17:00:
非常感谢你的帖子 我想请教一下几个问题:为什么在弹出的对话框里要选择no呢?什么时候选yes?
还有就是为什么第二种好呢?第一中的劣势在什么地方?
最后一个问题就是,前两天听说不论在计算什么性质之前,都要 ...

1.  选yes的话,就变成primitive cell(初基元胞)了,选no是为了保持现在的conventional cell
2.  选哪种因人而异吧,我是感觉第二种方便,能够清楚的看到晶格常数变化的百分比
3.  Make P1是为了维持周期性吧
9楼2009-06-11 18:22:58
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查看全部 21 个回答

abinitio

版主 (著名写手)


此贴很强大,收藏了,谢谢分享
3楼2009-06-09 20:12:16
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huangyc

木虫 (正式写手)


★★★ 三星级,支持鼓励

恩,是个方法
不过不用这么烦的,直接存成cif文件不就OK了嘛。如果想用cartesian的话转成xyz
5楼2009-06-09 21:38:57
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xujc1983

木虫 (著名写手)


引用回帖:
Originally posted by huangyc at 2009-6-9 21:38:
恩,是个方法
不过不用这么烦的,直接存成cif文件不就OK了嘛。如果想用cartesian的话转成xyz

呵呵,还好吧,有现成的POSCAR,一拷就完事了
cif没有用过,以后试试
7楼2009-06-09 21:55:11
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