| 查看: 2181 | 回复: 9 | ||
tatum木虫 (正式写手)
|
[求助]
关于DS对接时辅酶的处理 已有1人参与
|
|
请教大家个问题，在使用discovery studio进行对接时，有些酶，例如醇脱氢酶，转氨酶等，带有辅酶NAD或者PLP，在对接的时候，怎么处理的？ 例如转氨酶 1M32，pdb中带有PLP辅酶，这个辅酶和配体同时存在于活性口袋，在反应时要参与反应。 但是，我在对接的时候，如果保留PLP，再与其它配体进行对接，只有LiDock可以进行下去，Gold和CDock都会报错，只有删掉PLP之后才能继续进行对接，但删掉PLP的对接结果可能与实际情况差别很大。 请问大家是怎么做的，是不是我操作有误？ |
回复此楼» 猜你喜欢
售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急
已经有9人回复
-
时间戳今天，20号变了
已经有5人回复
-
2026国自然函评费到账
已经有9人回复
-
放榜前的不淡定
已经有14人回复
-
建议基金发布提前给出明确的时间点
已经有13人回复
-
今日不放榜？网传国自然预计 8 月 27 日可查结果
已经有20人回复
-
科研孤儿太难了
已经有18人回复
-
看来今天不会放榜了？
已经有11人回复
-
时间戳又变了
已经有19人回复
-
filecode，4个jtjc了
已经有14人回复
2楼2019-11-12 12:05:57
|
本帖内容被屏蔽 |
3楼2020-01-02 11:18:02
|
本帖内容被屏蔽 |
4楼2020-01-03 14:27:08
tatum
木虫 (正式写手)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 4602.9
- 散金: 220
- 红花: 4
- 帖子: 525
- 在线: 621.1小时
- 虫号: 604555
- 注册: 2008-09-17
- 性别: GG
- 专业: 绿色有机化学
5楼2020-01-03 19:21:41
tatum
木虫 (正式写手)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 4602.9
- 散金: 220
- 红花: 4
- 帖子: 525
- 在线: 621.1小时
- 虫号: 604555
- 注册: 2008-09-17
- 性别: GG
- 专业: 绿色有机化学
6楼2020-01-03 19:22:04
|
本帖内容被屏蔽 |
7楼2020-01-04 16:30:54
|
本帖内容被屏蔽 |
8楼2020-01-08 10:47:57
|
本帖内容被屏蔽 |
9楼2020-01-09 14:45:02
10楼2020-03-04 22:14:24
40