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琪琪577

新虫 (小有名气)

[交流] 江湖救急 已有2人参与

诶,惭愧。这个PCR折磨了我一个多月了。刚开始部分能p出来,几个挑单克隆测序不对,测序出来了3个,后面再做pcr怎么p都不出来了,用什么酶都试了一遍,退火条件也试过了,都跑不出来。用基因组DNA也不行,跑出来几个,纯化后连接转化挑不出阳性。PCR卡就算了,好几个还都卡在阳性挑不出来,好郁闷啊,后面觉得是引物可能设的不好,所以重设了引物,但是也就提高了退火,降低了上下游的差异在差中选优,还是没有扩增出来。想问问有没有有经验的,想请教一下,是模板的问题吗?RNA打算重新提一下。阳性挑不出来又该怎么调整呢,用的是重组连接酶,和这个有关系吗?

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琪琪577

新虫 (小有名气)

2楼2019-10-30 20:53:05
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1234567!。

新虫 (小有名气)

3楼2019-10-30 23:05:33
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Acov

新虫 (小有名气)

★ ★
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西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2019-10-31 22:48:05
首先 你这是提什么的rna rna跑胶情况图有吗 引物是根据什么来设计的 推荐pcr温度多少

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4楼2019-10-31 00:29:30
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琪琪577

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by Acov at 2019-10-31 00:29:30
首先 你这是提什么的rna rna跑胶情况图有吗 引物是根据什么来设计的 推荐pcr温度多少

提的水稻的RNA有两条带,第三条带看不到。是不是不太好,浓度在1300ng左右,引物是按照infusion的要求设的除了酶切位点有15个碱基的模板匹配,剩余分别基因的cds两端,推荐的退火在60℃左右

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5楼2019-10-31 11:47:23
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Acov

新虫 (小有名气)

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by 琪琪577 at 2019-10-31 11:47:23
提的水稻的RNA有两条带,第三条带看不到。是不是不太好,浓度在1300ng左右,引物是按照infusion的要求设的除了酶切位点有15个碱基的模板匹配,剩余分别基因的cds两端,推荐的退火在60℃左右
...

以前p出来的条带怎么样 如果以前条带可以 就还是提完rna按照以前的来试试

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6楼2019-10-31 20:03:42
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琪琪577

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by Acov at 2019-10-31 20:03:42
以前p出来的条带怎么样 如果以前条带可以 就还是提完rna按照以前的来试试
...

嗯,最开始还是能p出来几个的,量不高够做连接。是,现在就打算重提了再来p一下

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7楼2019-10-31 20:11:50
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