24小时热门版块排行榜    

查看: 1683  |  回复: 5

Myprayert

木虫 (正式写手)

[求助] 请问用lammps如何建立水分子 已有1人参与

请问用lammps如何建立水分子,十分感谢
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
Myprayert: 金币+50, ★★★★★最佳答案 2019-10-22 16:56:05
最简单的,VMD 建好了之后,用topo writelammpsdata water.data,就可以建好了
2楼2019-10-22 09:32:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Myprayert

木虫 (正式写手)

内容已删除
3楼2019-10-22 16:39:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Myprayert

木虫 (正式写手)

内容已删除
4楼2019-10-22 16:55:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

引用回帖:
4楼: Originally posted by Myprayert at 2019-10-22 16:55:49
老师,请问vmd能统计某一区域的原子个数吗?...

可以,比如,我想统计z>50  且 z<100 这个区域中水分子的个数,可以使用下面的命令:

set sel [atomselect top "type OW and z>50 and z<100 "]
$sel num

这时在VMD tkConsole的界面中,显示的就是水分子中的氧原子个数,即水分子个数。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

5楼2019-10-23 08:41:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Myprayert

木虫 (正式写手)

送红花一朵
内容已删除
6楼2019-10-23 18:48:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 Myprayert 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 0703化学调剂 +5 小奶苍 2026-03-07 5/250 2026-03-09 14:14 by Miss lee
[考研] 086000生物与医药319分求调剂 +4 Tolkien 2026-03-07 4/200 2026-03-09 13:49 by macy2011
[考研] 求调剂,数一英一274分 +4 小菲会努力 2026-03-08 4/200 2026-03-09 12:40 by 一定上岸哟_
[考研] 0817一志愿苏州大学280复试调剂 +3 kk扛 2026-03-07 3/150 2026-03-09 05:46 by houyaoxu
[考研] 一志愿武理314求调剂 +4 ( ̄~ ̄;) 2026-03-08 5/250 2026-03-08 23:12 by L135790
[考研] 新疆大学地质与矿业工程学院招生 +18 another12 2026-03-04 25/1250 2026-03-08 23:06 by silly。boy
[考研] 0701-322 求调剂 +3 jiliuxian 2026-03-06 8/400 2026-03-08 19:31 by jiliuxian
[考研] 求调剂 +3 拾柒12。 2026-03-08 3/150 2026-03-08 17:33 by bingxueer79
[考研] 286求调剂 +12 Faune 2026-03-06 14/700 2026-03-08 14:54 by hmn_wj
[考研] 22408 275分求调剂 +3 宇智波比 2026-03-03 4/200 2026-03-08 12:47 by AaAa7420
[考研] 不限学校专业的调剂同学看过来 +5 啊摆啊摆 2026-03-05 9/450 2026-03-06 12:06 by 啊摆啊摆
[考研] 求调剂 +5 danyyyy 2026-03-04 5/250 2026-03-06 08:16 by Leeding1356
[考研] 0856材料与化工求调剂! +5 化工考生111 2026-03-04 11/550 2026-03-06 01:20 by 化工考生111
[考研] 材料与化工304求调剂 +7 邱gl 2026-03-05 10/500 2026-03-06 01:11 by 卷柏卷柏
[考研] 271求调剂 +7 月色c 2026-03-05 8/400 2026-03-05 19:51 by wangjihu
[考研] 材料调剂 +4 L9370 2026-03-05 4/200 2026-03-05 19:36 by caszguilin
[考研] 一志愿天津大学085600 319分 材料与化工 金属方向 求调剂 +6 青科11 2026-03-02 6/300 2026-03-05 10:05 by oxidpl
[考研] 085600 材料与化工 298 +14 小西笑嘻嘻 2026-03-03 14/700 2026-03-04 16:23 by sslc1985
[考研] 281求调剂 +3 我是小小葱葱 2026-03-03 5/250 2026-03-04 14:23 by kakakapanpan
[考研] 0703化学学硕 288分 +4 旅行中的紫葡萄 2026-03-03 4/200 2026-03-03 23:41 by ch1979
信息提示
请填处理意见