应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 请问用lammps如何建立水分子
61/1返回列表
查看: 1681  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

Myprayert

木虫 (正式写手)

[求助] 请问用lammps如何建立水分子 已有1人参与

请问用lammps如何建立水分子，十分感谢
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2019-10-22 00:18:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
Myprayert: 金币+50, ★★★★★最佳答案 2019-10-22 16:56:05
最简单的，VMD 建好了之后，用topo writelammpsdata water.data，就可以建好了
赞一下 回复此楼
2楼2019-10-22 09:32:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Myprayert

木虫 (正式写手)
内容已删除
回复此楼
3楼2019-10-22 16:39:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Myprayert

木虫 (正式写手)
内容已删除
回复此楼
4楼2019-10-22 16:55:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)
引用回帖:
4楼: Originally posted by Myprayert at 2019-10-22 16:55:49
老师，请问vmd能统计某一区域的原子个数吗？...

可以，比如，我想统计z>50  且 z<100 这个区域中水分子的个数，可以使用下面的命令：

set sel [atomselect top "type OW and z>50 and z<100 "]
$sel num

这时在VMD tkConsole的界面中，显示的就是水分子中的氧原子个数，即水分子个数。
赞一下(1人) 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

Myprayert
5楼2019-10-23 08:41:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Myprayert

木虫 (正式写手)
送红花一朵
内容已删除
回复此楼
6楼2019-10-23 18:48:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 Myprayert 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 347求调剂 +4 浮云满足 2026-03-07 4/200 2026-03-08 16:46 by 星空星月
[考研] 290 材料与化工求调剂 +3 Nebulala 2026-03-08 3/150 2026-03-08 15:45 by 吃骨头的欢欢丫
[考研] 调剂的同学，走过路过，不要错过 +10 likeihood 2026-03-06 15/750 2026-03-08 15:40 by 纠缠体
[考研] 一志愿武汉理工085601，初试301分，请问能调剂到湖北吗 +3 肖yang 2026-03-06 3/150 2026-03-07 19:08 by ms629
[考研] 一志愿哈尔滨工业大学0856材料与化工，前三科206，总分283，求调剂 +7 26考研求调剂 2026-03-06 7/350 2026-03-07 14:49 by Miko19
[考研] 278求调剂 +5 Gale1314 2026-03-06 5/250 2026-03-07 14:41 by 2735147993
[考研] 085600材料与化工 298 调剂 +11 小西笑嘻嘻 2026-03-03 11/550 2026-03-07 10:30 by 一直走不要停
[考研] 求调剂 +4 呼呼？~+123456 2026-03-06 4/200 2026-03-06 23:11 by L135790
[考研] 308求调剂 +7 倘若起风了呢 2026-03-05 9/450 2026-03-06 22:59 by 倘若起风了呢
[考研] 材料与化工304求调剂 +7 邱gl 2026-03-05 10/500 2026-03-06 01:11 by 卷柏卷柏
[考研] 085602 293分求调剂 +3 SivanNano. 2026-03-05 3/150 2026-03-05 19:41 by caszguilin
[考研] 中国科学技术大学材料与化工281求调剂，有科研和获奖经历 +11 wsxw 2026-03-02 12/600 2026-03-05 09:49 by oxidpl
[论文投稿] 主编终审卡者不动 100+4 Stray2021 2026-03-03 4/200 2026-03-05 08:04 by bdhaoxiang
[考研] 求调剂院校 +6 云朵452 2026-03-02 12/600 2026-03-04 23:17 by 云朵452
[考研] 293求调剂 +3 是乐渝哇 2026-03-04 3/150 2026-03-04 23:12 by wutongshun
[考研] 一志愿武汉理工大学-085602-总分296分-求调剂 +7 紫川葡柚 2026-03-04 7/350 2026-03-04 21:04 by kakakapanpan
[考研] 282求调剂 +5 2103240126 2026-03-02 8/400 2026-03-04 17:29 by 妄深于海
[考研] 0857求调剂 +4 CDDD1013 2026-03-04 4/200 2026-03-04 16:08 by zhukairuo
[考研] 武理材料工程302调剂 +3 Doleres 2026-03-03 6/300 2026-03-04 15:54 by zhukairuo
[考研] 278求调剂 +3 满天星11_22 2026-03-02 3/150 2026-03-03 13:51 by Iveryant
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭