应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 请问用lammps如何建立水分子
51/1返回列表
查看: 1821  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

Myprayert

木虫 (正式写手)

[求助] 请问用lammps如何建立水分子 已有1人参与

请问用lammps如何建立水分子，十分感谢
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2019-10-22 00:18:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)
引用回帖:
4楼: Originally posted by Myprayert at 2019-10-22 16:55:49
老师，请问vmd能统计某一区域的原子个数吗？...

可以，比如，我想统计z>50  且 z<100 这个区域中水分子的个数，可以使用下面的命令：

set sel [atomselect top "type OW and z>50 and z<100 "]
$sel num

这时在VMD tkConsole的界面中，显示的就是水分子中的氧原子个数，即水分子个数。
赞一下(1人) 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

Myprayert
5楼2019-10-23 08:41:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
Myprayert: 金币+50, ★★★★★最佳答案 2019-10-22 16:56:05
最简单的，VMD 建好了之后，用topo writelammpsdata water.data，就可以建好了
赞一下 回复此楼
2楼2019-10-22 09:32:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭