24小时热门版块排行榜    

查看: 2402  |  回复: 11
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

zmcwangyang

铁杆木虫 (著名写手)


[交流] 求助,做分子对接时配体是否都需要预先能量最小化吗?

求助,做分子对接时化合物结构是通过scifinder、pubchem等化合物下载的,导入ADT处理时有部分配体出现如图所示的问题,网上找的解决方法是通过Chem3D能量最小化,方法是可以的,有一个疑问,另外一部分没出问题的化合物需要能量最小化再去对接吗?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zmcwangyang

铁杆木虫 (著名写手)


引用回帖:
4楼: Originally posted by longdlut at 2019-08-08 08:19:18
大虾,图呢

图总是上传不了,想请问分子对接前配体是否一定要能量最小化处理
6楼2019-08-08 16:14:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答

longdlut

捐助贵宾 (著名写手)



zmcwangyang(金币+1): 谢谢参与
4楼2019-08-08 08:19:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

carrystar

木虫 (正式写手)



zmcwangyang(金币+1): 谢谢参与
能量最小化后,可以为对接时的构象搜索设置一个起点

发自小木虫Android客户端
8楼2019-08-12 08:43:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jieenpeixi

禁虫 (初入文坛)


zmcwangyang(金币+1): 谢谢参与
本帖内容被屏蔽

10楼2019-09-29 22:35:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
2019-08-08 16:11   回复  
引用回帖:
4楼: Originally posted by longdlut at 2019-08-08 08:19:18 大虾,图呢

普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 265求调剂 +9 小木虫085600 2026-03-09 12/600 2026-03-14 01:11 by JourneyLucky
[考研] 材料与化工(0856)304求B区调剂 +6 邱gl 2026-03-12 7/350 2026-03-13 23:24 by 邱gl
[考研] 285 求调剂 资源与环境 一志愿北京化工大学 +3 未名考生 2026-03-10 3/150 2026-03-13 23:04 by JourneyLucky
[考研] 0703化学一志愿211 总分320求调剂 +5 玛卡巴卡啊哈 2026-03-11 5/250 2026-03-13 21:40 by JourneyLucky
[考研] 281求调剂 +9 Koxui 2026-03-12 11/550 2026-03-13 20:50 by Koxui
[考研] 26调剂/材料科学与工程/总分295/求收留 +9 2026调剂侠 2026-03-12 9/450 2026-03-13 20:46 by 18595523086
[考研] 材料工程调剂 +4 咪咪空空 2026-03-11 4/200 2026-03-13 19:57 by JourneyLucky
[考研] 求b区学校调剂 +3 周56 2026-03-11 3/150 2026-03-13 16:20 by JourneyLucky
[考研] 工科调剂 +4 Jiang191123! 2026-03-11 4/200 2026-03-13 15:15 by Miko19
[考研] 255求调剂 +3 李嘉慧, 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:14 by userper
[考研] 289求调剂 +3 李政莹 2026-03-12 3/150 2026-03-13 11:02 by 求调剂zz
[考研] 求调剂 资源与环境 285 +3 未名考生 2026-03-10 3/150 2026-03-13 10:31 by houyaoxu
[基金申请] 面上和青基一样限30页不合理 +4 wowsunflower 2026-03-10 6/300 2026-03-12 15:59 by Equinoxhua
[考研] 083000环境科学与工程调剂 +8 mingmingry 2026-03-09 9/450 2026-03-11 10:23 by 沙漠之狐994
[考研] 材料工程307,求调剂 +7 我要燃烧你的梦 2026-03-08 7/350 2026-03-11 09:09 by 剑诗杜康
[考研] 求调剂材料专硕293 +6 段_(:з」∠)_ 2026-03-10 6/300 2026-03-10 18:22 by ms629
[考研] 085602化工求调剂 +7 董boxing 2026-03-10 7/350 2026-03-10 17:07 by BruceLiu320
[考研] 材料与化工求调剂 +11 与冬清宁 2026-03-07 14/700 2026-03-10 14:23 by Linda Hu
[考研] 数二英二309分请求调剂 +3 dtdxzxx 2026-03-09 4/200 2026-03-09 19:56 by yuningshan
[考研] 调剂 +3 13853210211 2026-03-08 3/150 2026-03-08 19:34 by ms629
信息提示
请填处理意见