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小千100

新虫 (小有名气)

[求助] 同源重组多片段连接做不出来,我想重新做但又不知道是哪里操作的问题,怎么改进? 已有3人参与

使用的是诺维赞多片段连接试剂盒,引物用公司的在线软件设计的。载体8000多bp,三个片段分别1019,381,250多。
1.载体用takara快切酶双酶切30min,切胶回收,目的片段分别以之前的2个T载体扩增,一个质粒扩增,切胶回收。
2.分别稀释跑胶估算载体、三个片段浓度,按片段长度计算大致每个片段需要多少ng,加入多少μl
3.按说明书分别加入4μl载体,三个片段2μl,1μl,1μl,酶和buffer分别2μl,4μl,总体积20μl。37度反应30min。
4.10μl重组产物转化100μl大肠杆菌感受态,过夜培养挑单菌落(比较少)
5.挑了9个单菌落摇菌提了质粒,双酶切都没有切出片段。
6.同时我做了两个阴性对照1和2,都长了很多单菌落。1是只加了载体4μl,加水至20μl.2是只加了三个片段,加水至20μl.

@wizardfan @youlinglyw @biostar2009 发自小木虫Android客户端
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小千100

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 大-木-虫 at 2019-07-27 18:40:00
多片段重组有一个效率问题,你的片段差别比较大,也会影响效率,只要按照标准体系做的,理论上就没问题,成不成的就看运气了,所谓的多片段也并没有说的那么神奇,在保证同源臂设计正确,长度足够的情况下,只能重复 ...

是的,我觉得有时候碰运气,后面我重复了就连成了,具体哪里问题我也不清楚。还有一个问题就是我其中一个酶切位点上下游GC含量偏低,没达到说明书中的40%-60%之间。这个应该也是一个因素影响连接效率,总之严格按说明书的来应该不会错的。

发自小木虫Android客户端
8楼2019-08-06 19:14:38
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小千100

新虫 (小有名气)

希望各位老师可以帮忙我指出问题,我重新做,刚入门不久的小白,谢谢大家了

发自小木虫Android客户端
2楼2019-07-24 10:02:34
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xinxiyuzhou

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2019-07-24 18:02:51
有一个问题呀,你的阴性对照不加片段或者载体应该不会形成环状质粒,怎么会长出菌落呢?另外,你可以试一下将三个片段通过PCR连接起来再克隆到载体上。诺唯赞来我们这推销过这个试剂盒,我觉得没有什么优势,即使你现在克隆上了,还是要切下来,再进行后续的酶切连接,并没有省事。个人建议。
3楼2019-07-24 12:13:01
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匿名

用户注销 (正式写手)

本帖仅楼主可见
4楼2019-07-27 18:40:00
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