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小千100

新虫 (小有名气)

[求助] 同源重组多片段连接做不出来,我想重新做但又不知道是哪里操作的问题,怎么改进? 已有3人参与

使用的是诺维赞多片段连接试剂盒,引物用公司的在线软件设计的。载体8000多bp,三个片段分别1019,381,250多。
1.载体用takara快切酶双酶切30min,切胶回收,目的片段分别以之前的2个T载体扩增,一个质粒扩增,切胶回收。
2.分别稀释跑胶估算载体、三个片段浓度,按片段长度计算大致每个片段需要多少ng,加入多少μl
3.按说明书分别加入4μl载体,三个片段2μl,1μl,1μl,酶和buffer分别2μl,4μl,总体积20μl。37度反应30min。
4.10μl重组产物转化100μl大肠杆菌感受态,过夜培养挑单菌落(比较少)
5.挑了9个单菌落摇菌提了质粒,双酶切都没有切出片段。
6.同时我做了两个阴性对照1和2,都长了很多单菌落。1是只加了载体4μl,加水至20μl.2是只加了三个片段,加水至20μl.

@wizardfan @youlinglyw @biostar2009 发自小木虫Android客户端
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匿名

用户注销 (正式写手)

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4楼2019-07-27 18:40:00
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小千100

新虫 (小有名气)

希望各位老师可以帮忙我指出问题,我重新做,刚入门不久的小白,谢谢大家了

发自小木虫Android客户端
2楼2019-07-24 10:02:34
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xinxiyuzhou

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2019-07-24 18:02:51
有一个问题呀,你的阴性对照不加片段或者载体应该不会形成环状质粒,怎么会长出菌落呢?另外,你可以试一下将三个片段通过PCR连接起来再克隆到载体上。诺唯赞来我们这推销过这个试剂盒,我觉得没有什么优势,即使你现在克隆上了,还是要切下来,再进行后续的酶切连接,并没有省事。个人建议。
3楼2019-07-24 12:13:01
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prthefu

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小千100(渊博震天代发): 金币+20, 鼓励积极回帖 2019-08-11 15:21:03
你是要做原核菌的同源重组吗?我这两天也刚查这方面的资料,简单说一下我的见解,仅供交流。
三片段各自扩增好后,先进行连接,然后再把融合好的打靶片段通过TA克隆链接到载体上,转入目的菌后进行筛选就可以。
大体流程是这样,说着不难,但确实是做的过程中会有很多问题。
你上面提到的疑惑,多片段和载体共同连接转化后,没什么单菌落,那可能是连接效率不太好。
另外,你挑了单克隆摇菌提质粒,再双酶切,是什么目的呢?连上了为什么又要切开?
最后,你所谓的阴性对照1只加了载体,你指的是线性化的载体吗?那不应该会长菌啊。如果是空载,是会有正常菌落的。
                       阴性对照2是加入了三个基因片段,理论上也不会长菌啊,为什么你的也有呢?
nothing is impossible in this world,if you have the will to win,you can achieve anything
5楼2019-08-06 15:42:27
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