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【求助】经过动力学模拟后模型的RMSD值变大?
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由于是非专业人士,在进行AUTODOCK前期的同源模型构建时,用的是SWISS-MODEL,为了提高模型的可信程度,采用NAMD进行分子动力学模拟,持续300PS,结果RMSD增加了接近50%,最后稳定在2左右,请问这样的现象是否合理? [ Last edited by lei0736 on 2009-11-25 at 12:13 ] |
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