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yuzhongbaihe

新虫 (正式写手)

[求助] 测序结果分析 已有3人参与

我拿一个重组质粒送公司测序，几天后公司给返反馈了拼接结果和测序的每一个片段，请问怎样拿这些小片段自己尝试拼接然后和原序列比对呢，怎么区分哪个是5，端哪个是3，端呢，求大神赐教，本人新手，完全蒙圈状态，自己看网上的教程也晕乎

@youlinglyw @wizardfan @飞约疯人院 @biostar2009 发自小木虫Android客户端
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1楼 2019-06-26 23:04:30
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王菲0913

新虫 (著名写手)
★
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2019-06-27 22:43:55
可以总vector int10的软件和自己原有饿序列做对比

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2楼2019-06-26 23:08:06
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世俗之风

禁虫 (正式写手)
本帖内容被屏蔽
3楼2019-06-27 05:54:56
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匿名

用户注销 (正式写手)
★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2019-06-27 22:43:26
本帖仅楼主可见
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4楼2019-06-27 09:20:27
已阅   申请MolEPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

xinxiyuzhou

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2019-06-27 22:43:35
一般情况下，碱基的序列都是从5’到3’排列的。将你的原始序列和测序拼接结果用DNAstar的seqman分别打开进行比对，看是否有突变。你直接百度DNAstar的seqman的使用教程吧。有不懂的再问。
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

yuzhongbaihe
5楼2019-06-27 09:33:07
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yuzhongbaihe

新虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by xinxiyuzhou at 2019-06-27 09:33:07
一般情况下，碱基的序列都是从5’到3’排列的。将你的原始序列和测序拼接结果用DNAstar的seqman分别打开进行比对，看是否有突变。你直接百度DNAstar的seqman的使用教程吧。有不懂的再问。

好的，谢谢

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6楼2019-06-27 12:57:53
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Moliy_yaya

新虫 (初入文坛)
这个不知道你解决了没有，我是直接给测序公司发邮件让他们给我拼的

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7楼2019-07-22 01:07:30
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zoeyang_96

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

可以让公司把拼好的序列发给你，我自己拼接的话用的是dnastar软件的Seqman。
Seqman的使用方法：https://wenku.baidu.com/view/2510ca7965ce05087732133d.html
（但是我至今也不会批量拼接，只能两两序列拼接，不过好在我测序也不多）
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8楼2019-07-22 11:56:44
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