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yuzhongbaihe

新虫 (正式写手)

[求助] 测序结果分析 已有3人参与

我拿一个重组质粒送公司测序,几天后公司给返反馈了拼接结果和测序的每一个片段,请问怎样拿这些小片段自己尝试拼接然后和原序列比对呢,怎么区分哪个是5,端哪个是3,端呢,求大神赐教,本人新手,完全蒙圈状态,自己看网上的教程也晕乎

@youlinglyw @wizardfan @飞约疯人院 @biostar2009 发自小木虫Android客户端
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王菲0913

新虫 (著名写手)


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2019-06-27 22:43:55
可以总vector int10的软件和自己原有饿序列做对比

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2楼2019-06-26 23:08:06
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世俗之风

禁虫 (正式写手)

本帖内容被屏蔽

3楼2019-06-27 05:54:56
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匿名

用户注销 (正式写手)


感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2019-06-27 22:43:26
本帖仅楼主可见
4楼2019-06-27 09:20:27
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xinxiyuzhou

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2019-06-27 22:43:35
一般情况下,碱基的序列都是从5’到3’排列的。将你的原始序列和测序拼接结果用DNAstar的seqman分别打开进行比对,看是否有突变。你直接百度DNAstar的seqman的使用教程吧。有不懂的再问。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

5楼2019-06-27 09:33:07
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yuzhongbaihe

新虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by xinxiyuzhou at 2019-06-27 09:33:07
一般情况下,碱基的序列都是从5’到3’排列的。将你的原始序列和测序拼接结果用DNAstar的seqman分别打开进行比对,看是否有突变。你直接百度DNAstar的seqman的使用教程吧。有不懂的再问。

好的,谢谢

发自小木虫Android客户端
6楼2019-06-27 12:57:53
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Moliy_yaya

新虫 (初入文坛)

这个不知道你解决了没有,我是直接给测序公司发邮件让他们给我拼的

发自小木虫IOS客户端
7楼2019-07-22 01:07:30
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zoeyang_96

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

可以让公司把拼好的序列发给你,我自己拼接的话用的是dnastar软件的Seqman。
Seqman的使用方法:https://wenku.baidu.com/view/2510ca7965ce05087732133d.html
(但是我至今也不会批量拼接,只能两两序列拼接,不过好在我测序也不多)
8楼2019-07-22 11:56:44
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