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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 核酸杂交 » DNA发夹结构的充分形成 HCR反应
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小漫画正青春

新虫 (初入文坛)

[求助] DNA发夹结构的充分形成 HCR反应已有3人参与

想请教一下，一条发卡DNA，95℃变性以后怎么操作让DNA尽可能的全部转化为发卡结构啊，我是后续用来做HCR反应定量检测miRNA的应用
我看文献里写的是发夹DNA在95℃变性5min后，缓慢冷却至室温。①那这个冷却的过程是直接放在室内缓慢冷却还是在PCR仪上设置梯度降温比较好噢？如果设置②在变性之前，DNA粉末就直接加三蒸水配置就好了吗，还是说需要加 annealing buffer（退火缓冲液）？

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1楼2019-06-06 11:39:47
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南工邓

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2019-08-18 21:59:46
题主你好，我现在也在做这一方面的课题，可以交流一下。
我做的时候，就是直接放在室温冷却的，不过我使用热水浴，然后连同热水一起冷却，大概四个小时到室温。
然后DNA我是直接加buffer溶解，就是实验用到的缓冲液，不是退火缓冲液。
我现在也有困难，不知道题主做到什么地步了，希望与题主交流一下经验。
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哈哈哈，人生且歌且酒且狂乐！
2楼2019-07-17 21:21:07
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欧尼_wy

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

请问大家的发卡序列都是怎么设计的，有没有什么遵循的原则或者规律啊？另外最近跑非变性PAGE电泳，单独的发卡结构没有条带，跑了好几次都是这样
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9楼2020-09-27 08:59:17
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西樵9797

新虫 (小有名气)
请问两条发夹dna能不能反应啊？

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3楼2019-08-18 19:43:51
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南工邓

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 西樵9797 at 2019-08-18 19:43:51
请问两条发夹dna能不能反应啊？

互补的情况下，需要外力打开发夹结构，比如加热，然后能互补形成双链。两个稳定的发夹结构，一般是不会自己打开的
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哈哈哈，人生且歌且酒且狂乐！
4楼2019-09-09 19:48:10
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西樵9797

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 南工邓 at 2019-09-09 19:48:10
互补的情况下，需要外力打开发夹结构，比如加热，然后能互补形成双链。两个稳定的发夹结构，一般是不会自己打开的...

但是我跑胶显示两条发夹DNA能杂交，是因为什么原因造成的啊

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5楼2019-09-09 19:58:23
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南工邓

新虫 (小有名气)
是不是一个发夹的单链部分和另一个发夹互补啊？比如茎上两条链不一样长，可能长的那一截打开了另一个茎环

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6楼2019-09-10 00:05:00
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小漫画正青春

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 南工邓 at 2019-07-17 21:21:07
题主你好，我现在也在做这一方面的课题，可以交流一下。
我做的时候，就是直接放在室温冷却的，不过我使用热水浴，然后连同热水一起冷却，大概四个小时到室温。
然后DNA我是直接加buffer溶解，就是实验用到的缓冲 ...

目前就是加了靶标，荧光一直恢复不起来
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7楼2019-09-16 15:19:58
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哈利波特2000

新虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 南工邓 at 2019-07-17 21:21:07
题主你好，我现在也在做这一方面的课题，可以交流一下。
我做的时候，就是直接放在室温冷却的，不过我使用热水浴，然后连同热水一起冷却，大概四个小时到室温。
然后DNA我是直接加buffer溶解，就是实验用到的缓冲 ...

可以交流一下吗？我也在做这一块
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8楼2020-02-10 13:39:41
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悲催的小王?

新虫 (初入文坛)
题主您好，我想问一下您现在确定了发夹结构怎样才能更好的形成了吗？我刚开始，一头雾水

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10楼2021-01-22 11:36:02
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