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新虫
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请问一下各位大佬,用AIMD计算扩散时内部原子的运动有规律吗?
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2019-05-12 16:30:01
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新虫
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16楼
:
Originally posted by
iamikaruk
at 2019-05-13 18:45:40
有的,沿着不同路径的激活能不同,扩散的hopping rate也不同,统计上是有规律的,而不是完全的布朗运动。...
还想请问一下,处理得到的msd文件用origin打开后第一列是X轴,第五列是平均值,第二到四节分别是跃动原子的x y z 轴的值吗?
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17楼
2019-05-13 20:58:26
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lixiaowei
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
请教一下,AIMD研究扩散,MSD是怎么计算的?你自己写的代码还是用的其它软件?谢谢!
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12楼
2019-05-12 19:35:36
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新虫
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引用回帖:
12楼
:
Originally posted by
lixiaowei
at 2019-05-12 19:35:36
请教一下,AIMD研究扩散,MSD是怎么计算的?你自己写的代码还是用的其它软件?谢谢!
MSD是同门搞出来的在VASP上的一个处理模块,具体怎么搞出来的我也不清楚 好像用python 这个软件也可以 但是具体我还是不清楚
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13楼
2019-05-12 20:14:43
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iamikaruk
木虫
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在线: 543.8小时
虫号: 1315985
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你想问的规律是指什么?可以用van Hove correlation function分析一下
另外处理msd有很多软件,比如说vmd,wxdragon,pymatgen
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小菜硕一枚
14楼
2019-05-13 13:48:28
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hdchina2010
2楼
2019-05-12 16:32
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zfpd2766
3楼
2019-05-12 16:33
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困困的黄瓜
4楼
2019-05-12 16:34
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小虫子爱学习
5楼
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wangzihan218
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tzynew
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2019-05-12 16:37
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longwave
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2019-05-12 16:39
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dzxylxm
9楼
2019-05-12 16:40
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筱懿灵轩
10楼
2019-05-12 16:42
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秋土豆香
11楼
2019-05-12 16:48
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