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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 含铂配合物分子动力学模拟力场选择
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xsw1EZUNT519

金虫 (初入文坛)

[求助] 含铂配合物分子动力学模拟力场选择 已有1人参与

求助各路大神，我想做一个铂配合物的分子动力学模拟，请问用什么力场可以呀？？有相应的文献就更好啦！！！！
之前请人帮忙用Gromacs做模拟，用的是UFF力场，效果不佳，上网百度了一下，有说用COMPASS力场的，可以吗？？
非常着急，请大家指点指点！！！
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1楼 2019-05-09 21:44:30
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xsw1EZUNT519

金虫 (初入文坛)
给自己顶一下
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2楼2019-05-09 21:49:38
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xsw1EZUNT519

金虫 (初入文坛)
没有人回复
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3楼2019-05-10 09:07:40
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xsw1EZUNT519

金虫 (初入文坛)
4楼2019-05-15 11:00:29
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Natsumecc

木虫 (著名写手)

大钛虫

【答案】应助回帖

GROMACS不支持COMPASS力场，若想使用COMPASS力场，请使用Materials Studio或者LAMMPS，UFF其实还好，主要是你得根据文献中报道的力场参数自己改一下某些参数。
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xsw1EZUNT519
哥上的不是小木虫，是寂寞
5楼2019-05-15 23:08:46
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xsw1EZUNT519

金虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by Natsumecc at 2019-05-15 23:08:46
GROMACS不支持COMPASS力场，若想使用COMPASS力场，请使用Materials Studio或者LAMMPS，UFF其实还好，主要是你得根据文献中报道的力场参数自己改一下某些参数。

主要是没有搜到相关的文献，还是谢谢啦
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6楼2019-05-16 20:29:42
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Natsumecc

木虫 (著名写手)

大钛虫
引用回帖:
6楼: Originally posted by xsw1EZUNT519 at 2019-05-16 20:29:42
主要是没有搜到相关的文献，还是谢谢啦...

可以高斯算一下得到诸如电荷之类的参数然后修改下uff的参数

发自小木虫IOS客户端
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哥上的不是小木虫，是寂寞
7楼2019-05-16 20:53:23
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blacksep

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by xsw1EZUNT519 at 2019-05-16 20:29:42
主要是没有搜到相关的文献，还是谢谢啦...

您好，请问后来做出来了吗？我发现obgmx有近似uff力场，但是我怎么找都找不到obgmx对应的立场文件，请问您有uff相关的立场文件吗？谢谢您
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8楼2020-01-25 19:54:12
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