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xsw1EZUNT519

金虫 (初入文坛)

[求助] 含铂配合物分子动力学模拟力场选择 已有1人参与

求助各路大神,我想做一个铂配合物的分子动力学模拟,请问用什么力场可以呀??有相应的文献就更好啦!!!!
之前请人帮忙用Gromacs做模拟,用的是UFF力场,效果不佳,上网百度了一下,有说用COMPASS力场的,可以吗??
非常着急,请大家指点指点!!!
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Natsumecc

木虫 (著名写手)

大钛虫

引用回帖:
6楼: Originally posted by xsw1EZUNT519 at 2019-05-16 20:29:42
主要是没有搜到相关的文献,还是谢谢啦...

可以高斯算一下得到诸如电荷之类的参数然后修改下uff的参数

发自小木虫IOS客户端
哥上的不是小木虫,是寂寞
7楼2019-05-16 20:53:23
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Natsumecc

木虫 (著名写手)

大钛虫

【答案】应助回帖

GROMACS不支持COMPASS力场,若想使用COMPASS力场,请使用Materials Studio或者LAMMPS,UFF其实还好,主要是你得根据文献中报道的力场参数自己改一下某些参数。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

哥上的不是小木虫,是寂寞
5楼2019-05-15 23:08:46
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xsw1EZUNT519

金虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by Natsumecc at 2019-05-15 23:08:46
GROMACS不支持COMPASS力场,若想使用COMPASS力场,请使用Materials Studio或者LAMMPS,UFF其实还好,主要是你得根据文献中报道的力场参数自己改一下某些参数。

主要是没有搜到相关的文献,还是谢谢啦
6楼2019-05-16 20:29:42
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blacksep

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by xsw1EZUNT519 at 2019-05-16 20:29:42
主要是没有搜到相关的文献,还是谢谢啦...

您好,请问后来做出来了吗?我发现obgmx有近似uff力场,但是我怎么找都找不到obgmx对应的立场文件,请问您有uff相关的立场文件吗?谢谢您
8楼2020-01-25 19:54:12
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