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表面电子云分布已有1人参与
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紧急求助:有没有大神指导下如何将fch文件转cub进而用GV查看表面电子云分布。能给具体步骤最好，非常感谢 @jiewei 发自小木虫IOS客户端 |
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2楼2019-04-22 23:13:56
paramecium86
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【答案】应助回帖
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zhou2009: 金币+8 2019-04-23 07:55:27
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zhou2009: 金币+8 2019-04-23 07:55:27
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可以用gview打开 fchk 之后再右键 选择 rusults---surface/contour--右上角的cube actions里选择 new cube就能生成 你想要的cube 看电子云分布 那就用 total density就可以。除此之外也可以plot 不同分子轨道的样子 等等。 也可用 gauss软件生成cube。linux下用cubegen 命令就行。输入类似 cubegen 8 density 1.fchk 1.cube 0 就可以。 8 代表计算生成cube所需要用的cpu核心数 ；density代表需要生成的cube包含的信息。这里是 电子密度 density； 0 代表用默认格点数 (80)^3； |
3楼2019-04-23 00:54:21
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您好，感谢您这么详细的答复，按照您的说法我试了下的到了这样子的图，这个图怎么看起来像是表面静电势的图？还有怎么用gauss把fch转cub文件呢，昨天试了一晚上都没成功，可不可以给个详细步骤，感之不尽！  发自小木虫IOS客户端 |
4楼2019-04-23 09:31:41
paramecium86
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【答案】应助回帖
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用linux版的Gauss生成 cube的方法 就是我之前回帖第二段里说的 cubegen命令 就是通过fchk 生成cube. 而且你得确定知道要生成那种cube才行。我不确定你所说的表面电子云分布指的是什么图 能不能给一个例子看看？ windows版gauss生成 cube的方法：进入G09w所在文件夹 找到一个叫cubegen.exe 的文件 双击 就会弹出一个dos窗口 首先问你需要生成什么样的cube 可以是 Density 电子密度 也可以是其它的 就看你需要生成什么。 确认之后 就是要输入fchk文件的文件名。我一般是把要转换的fchk直接放在G09w的这个文件夹下 直接打文件名就行了 不需要路径。 然后会问你要生成的cube文件的名字。 之后两个选项直接回车默认就行了。 都确认输入后 点回车 过一会 cube'就会生成了。 操作的截图我已经放在附件里了。  TIM截图20190422221955.png |
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5楼2019-04-23 10:22:43
送红花一朵|
感谢大佬的指导，按照您说的我用的chk文件转成cube,这块必须用fchk文件转cube吗？我用cube文件在GV里选择results-surfaces-cube action-new cube-type里面total density是灰色的选择不了，是不是因为我用的fch文件转的cube，还是因为其他的。我要这种电子密度图   发自小木虫IOS客户端 |
6楼2019-04-23 10:57:02
8