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AndyGreen

新虫 (小有名气)

[求助] 表面电子云分布已有1人参与

紧急求助:有没有大神指导下如何将fch文件转cub进而用GV查看表面电子云分布。能给具体步骤最好,非常感谢

@jiewei 发自小木虫IOS客户端
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paramecium86

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by AndyGreen at 2019-04-22 20:31:41
您好,感谢您这么详细的答复,按照您的说法我试了下的到了这样子的图,这个图怎么看起来像是表面静电势的图?还有怎么用gauss把fch转cub文件呢,昨天试了一晚上都没成功,可不可以给个详细步骤,感之不尽!

...

用linux版的Gauss生成 cube的方法 就是我之前回帖第二段里说的 cubegen命令 就是通过fchk 生成cube. 而且你得确定知道要生成那种cube才行。我不确定你所说的表面电子云分布指的是什么图 能不能给一个例子看看?

windows版gauss生成 cube的方法:进入G09w所在文件夹 找到一个叫cubegen.exe 的文件 双击 就会弹出一个dos窗口
                                                       首先问你需要生成什么样的cube 可以是 Density 电子密度 也可以是其它的 就看你需要生成什么。
                                                      确认之后 就是要输入fchk文件的文件名。我一般是把要转换的fchk直接放在G09w的这个文件夹下 直接打文件名就行了 不需要路径。
                                                      然后会问你要生成的cube文件的名字。
                                                      之后两个选项直接回车默认就行了。
都确认输入后 点回车 过一会 cube'就会生成了。

操作的截图我已经放在附件里了。
表面电子云分布
TIM截图20190422221955.png

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

5楼2019-04-23 10:22:43
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查看全部 6 个回答

爱人者人爱之

新虫 (正式写手)

百度上能找到如何看分子的HOMO和LOMO轨道,不知道对你有没有用。我也在尝试学这方面的东西,有点不懂

发自小木虫Android客户端
2楼2019-04-22 23:13:56
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paramecium86

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zhou2009: 金币+8 2019-04-23 07:55:27
可以用gview打开 fchk 之后再右键 选择 rusults---surface/contour--右上角的cube actions里选择 new cube就能生成 你想要的cube 看电子云分布 那就用 total density就可以。除此之外也可以plot 不同分子轨道的样子 等等。  

也可用 gauss软件生成cube。linux下用cubegen 命令就行。输入类似  cubegen 8 density 1.fchk 1.cube 0  就可以。  8 代表计算生成cube所需要用的cpu核心数 ;density代表需要生成的cube包含的信息。这里是 电子密度 density;   0 代表用默认格点数 (80)^3;
3楼2019-04-23 00:54:21
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AndyGreen

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by paramecium86 at 2019-04-23 00:54:21
可以用gview打开 fchk 之后再右键 选择 rusults---surface/contour--右上角的cube actions里选择 new cube就能生成 你想要的cube 看电子云分布 那就用 total density就可以。除此之外也可以plot 不同分子轨道的样子 ...

您好,感谢您这么详细的答复,按照您的说法我试了下的到了这样子的图,这个图怎么看起来像是表面静电势的图?还有怎么用gauss把fch转cub文件呢,昨天试了一晚上都没成功,可不可以给个详细步骤,感之不尽!
表面电子云分布-1



发自小木虫IOS客户端
4楼2019-04-23 09:31:41
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不应助 确定回帖应助 (注意:应助才可能被奖励,但不允许灌水,必须填写15个字符以上)
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