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玫瑰蔷薇月季

新虫 (初入文坛)

[求助] 基因扩增 已有1人参与

最近在克隆基因,以cDNA为模板来扩增基因,用普通的TAQ酶能够扩出来,但是条带不太亮,用takara的primerstart扩不出来,完全没有条带,求助各位大神这种情况应该怎么办?谢谢!

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remax520

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by tianhao0924 at 2019-07-01 20:43:58
请问,我也是用cDNA做模板,扩CDS区,一直扩不出来目的条带,需要加酶切位点,是不是引物是酶切位点+起始密码子以及后面15个碱基,但是上游引物的GC很少,AT很多,一直没有目的条带,有改进的方法吗?是不是引物设 ...

午饭这个问题,我会从如下几个方面考虑:1, cDNA是不是存在问题,需要电泳检测一下,如果是弥散的条带,说明反转录没有问题。2,引物设计问题,根据位点序列启动子和后续序列反复核对,是否需要互补等操作,某些碱基偏向但是问题不大,只要不行成特殊结构就好。3,利用扩增效率较好的rTaq进行扩增尝试。4,扩增条件,尤其是退火温度,可以根据引物合成时给定的Tm值进行释当调整进行扩增尝试。

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4楼2019-07-01 21:00:23
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remax520

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
酶的扩增效率和保真性是不同的,Taq酶的保真性差,但是扩增效率还是很好的。有的酶保真性高,因此扩增效率就会低一点,如果对扩增产物没有太高的保真性能的要求,用Taq酶就可以了

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2楼2019-04-17 20:09:21
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匿名

用户注销 (初入文坛)

本帖仅楼主可见
3楼2019-07-01 20:43:58
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