24小时热门版块排行榜    

查看: 1987  |  回复: 12
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

S-Loser

新虫 (正式写手)


已领完
转data文件
领取红包 (小木虫手机app专属红包)

扫一扫,下载小木虫客户端

1  我在MS里面建好模型后,转出pdb文件,再用VMD转data文件,得到的data文件里面没有键角和二面角信息我模拟的是材料的力学性能,模型的键角信息在data文件里应该要有吧。
2  大家在做分子动力学模拟的时候,有遇到过描述极化作用的势函数吗?

发自小木虫Android客户端
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

分子动力学-初级问题资源

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kevin_lt77

铁虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
请问你的第1个问题解决了吗?谢谢
13楼2020-03-10 06:39:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 13 个回答

lwd19831217

木虫 (著名写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我是做大分子的,按说和你差距很远,拿了你红包不说两句不好意思,pdb文件里面只有不同原子的位置,除了缺省的氨基酸外,其他小分子都要有个cif档案专门放键长键角啥的,您去看看ms里面有没有描述,如果是比较小的结构,我们一般用prodrg服务器上去画一下小分子,就会能生成带信息的文件了。

发自小木虫Android客户端
9楼2019-04-02 20:40:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

S-Loser

新虫 (正式写手)


好的,谢谢你,好人

发自小木虫Android客户端
11楼2019-04-02 21:05:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

红莉栖y

铁虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
要通过别的方式获得有键和角的data文件,vmd直接转的就是只有坐标信息
12楼2019-09-02 19:09:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
2019-04-02 20:34   回复  
S-Loser(金币+5): 谢谢参与
已获得5个金币 发自小木虫Android客户端
tzynew3楼
2019-04-02 20:26   回复  
S-Loser(金币+3): 谢谢参与
已获得3个金币 发自小木虫Android客户端
Nater1ver10楼
2019-04-02 20:40   回复  
S-Loser(金币+1): 谢谢参与
已获得1个金币 发自小木虫Android客户端
2019-04-02 20:22   回复  
S-Loser(金币+2): 谢谢参与
已获得2个金币 发自小木虫IOS客户端
dlli20148楼
2019-04-02 20:36   回复  
S-Loser(金币+2): 谢谢参与
已获得2个金币 发自小木虫Android客户端
gytxiaozi4楼
2019-04-02 20:26   回复  
S-Loser(金币+2): 谢谢参与
已获得2个金币 发自小木虫Android客户端
ri3yue36楼
2019-04-02 20:33   回复  
S-Loser(金币+4): 谢谢参与
已获得4个金币 发自小木虫Android客户端
Mr.LZP5楼
2019-04-02 20:26   回复  
S-Loser(金币+1): 谢谢参与
已获得1个金币 发自小木虫IOS客户端
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料调剂 +7 ounce. 2026-03-05 15/750 2026-03-08 09:39 by wangjihu
[考研] 中科大材料299求调剂 +10 DAIjiayo 2026-03-05 15/750 2026-03-08 09:18 by 波力海苔CUICUI
[考研] 理学287分求调剂 +3 看看我. 2026-03-05 3/150 2026-03-08 08:11 by 314126402
[考研] 材料专硕调剂 +5 慕辰123 2026-03-05 8/400 2026-03-07 15:54 by xuesongli73
[考研] 材料277分求调剂 +13 饭饭星球 2026-03-04 14/700 2026-03-06 16:10 by @飒飒飒飒
[考研] 08工科求调剂 +3 隆LLL 2026-03-06 4/200 2026-03-06 15:26 by 隆LLL
[考博] 2026申博自荐 六级440电催化方向 +4 樱落成影花成双 2026-03-05 4/200 2026-03-06 07:57 by L135790
[考研] 332材料求调剂 +6 zjy101327 2026-03-05 7/350 2026-03-06 00:18 by wutongshun
[考研] 085602 293分求调剂 +3 SivanNano. 2026-03-05 3/150 2026-03-05 19:41 by caszguilin
[考研] 347求调剂 +6 啊欧欧欧 2026-03-03 8/400 2026-03-05 11:40 by 0202liuyan
[考研] 0856材料专硕274能调剂去哪里? +3 22735 2026-03-04 4/200 2026-03-05 09:06 by 斩魂滴兔子!
[考研] 0703化学求调剂,总分320分,一志愿中南民族大学 +3 19286712440 2026-03-04 3/150 2026-03-04 18:30 by houyaoxu
[考研] 0855机械工程324求调剂 +3 郑SK 2026-03-02 7/350 2026-03-04 17:24 by congmingdou
[考研] 295求调剂 +4 小赛不吃香菜 2026-03-04 4/200 2026-03-04 16:13 by sslc1985
[考研] 武理材料工程302调剂 +3 Doleres 2026-03-03 6/300 2026-03-04 15:54 by zhukairuo
[考研] 0703 总分319求调剂 +4 Xinyuu 2026-03-02 4/200 2026-03-03 22:58 by 让我们一起快乐
[考研] 306求调剂 +7 张张张张oo 2026-03-03 7/350 2026-03-03 21:35 by L135790
[考研] 268求调剂 +10 简单点0 2026-03-02 14/700 2026-03-03 14:51 by pingping55
[考研] 材料085601调剂 +5 多多子. 2026-03-02 5/250 2026-03-02 19:15 by zhukairuo
[考研] 一志愿中石油(华东)本科齐鲁工业大学 +3 石能伟 2026-03-02 3/150 2026-03-02 18:54 by caszguilin
信息提示
请填处理意见