24小时热门版块排行榜    

查看: 1988  |  回复: 12
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

S-Loser

新虫 (正式写手)


已领完
转data文件
领取红包 (小木虫手机app专属红包)

扫一扫,下载小木虫客户端

1  我在MS里面建好模型后,转出pdb文件,再用VMD转data文件,得到的data文件里面没有键角和二面角信息我模拟的是材料的力学性能,模型的键角信息在data文件里应该要有吧。
2  大家在做分子动力学模拟的时候,有遇到过描述极化作用的势函数吗?

发自小木虫Android客户端
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

分子动力学-初级问题资源

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kevin_lt77

铁虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
请问你的第1个问题解决了吗?谢谢
13楼2020-03-10 06:39:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 13 个回答

lwd19831217

木虫 (著名写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我是做大分子的,按说和你差距很远,拿了你红包不说两句不好意思,pdb文件里面只有不同原子的位置,除了缺省的氨基酸外,其他小分子都要有个cif档案专门放键长键角啥的,您去看看ms里面有没有描述,如果是比较小的结构,我们一般用prodrg服务器上去画一下小分子,就会能生成带信息的文件了。

发自小木虫Android客户端
9楼2019-04-02 20:40:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

S-Loser

新虫 (正式写手)


好的,谢谢你,好人

发自小木虫Android客户端
11楼2019-04-02 21:05:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

红莉栖y

铁虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
要通过别的方式获得有键和角的data文件,vmd直接转的就是只有坐标信息
12楼2019-09-02 19:09:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
2019-04-02 20:34   回复  
S-Loser(金币+5): 谢谢参与
已获得5个金币 发自小木虫Android客户端
tzynew3楼
2019-04-02 20:26   回复  
S-Loser(金币+3): 谢谢参与
已获得3个金币 发自小木虫Android客户端
Nater1ver10楼
2019-04-02 20:40   回复  
S-Loser(金币+1): 谢谢参与
已获得1个金币 发自小木虫Android客户端
2019-04-02 20:22   回复  
S-Loser(金币+2): 谢谢参与
已获得2个金币 发自小木虫IOS客户端
dlli20148楼
2019-04-02 20:36   回复  
S-Loser(金币+2): 谢谢参与
已获得2个金币 发自小木虫Android客户端
gytxiaozi4楼
2019-04-02 20:26   回复  
S-Loser(金币+2): 谢谢参与
已获得2个金币 发自小木虫Android客户端
ri3yue36楼
2019-04-02 20:33   回复  
S-Loser(金币+4): 谢谢参与
已获得4个金币 发自小木虫Android客户端
Mr.LZP5楼
2019-04-02 20:26   回复  
S-Loser(金币+1): 谢谢参与
已获得1个金币 发自小木虫IOS客户端
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 2026考研求调剂-材料类-本科211一志愿985-初试301分 +5 虫友233 2026-03-07 5/250 2026-03-08 16:40 by 星空星月
[考研] 0817找调剂 +5 kk扛 2026-03-08 5/250 2026-03-08 15:46 by 星空星月
[考研] 材料工程专硕调剂自荐信,初试323 +4 李白26 2026-03-07 4/200 2026-03-07 21:59 by 星空星月
[考研] 一志愿武汉理工085601,初试301分,请问能调剂到湖北吗 +3 肖yang 2026-03-06 3/150 2026-03-07 19:08 by ms629
[考研] 085600材料与化工 292分 求调剂 +6 程晴之 2026-03-06 6/300 2026-03-07 09:22 by 斩魂滴兔子!
[考博] 申博 +3 添菜了哈 2026-03-04 6/300 2026-03-07 09:10 by 添菜了哈
[考研] 306求调剂 +7 Bahati 2026-03-05 7/350 2026-03-06 22:11 by 星空星月
[考研] 材料学硕318求调剂 +13 February_Feb 2026-03-01 13/650 2026-03-06 15:30 by GGOND
[考研] 08工科求调剂 +3 隆LLL 2026-03-06 4/200 2026-03-06 15:26 by 隆LLL
[考研] 274求调剂 +9 一个学习者 2026-03-04 9/450 2026-03-05 20:56 by 黑衣馒头人
[考研] 材料学学硕308分/本科东北大学/一志愿西北工业大学/ 5+3 苏尧幺幺 2026-03-03 8/400 2026-03-05 16:06 by njzyff
[考研] 085701环境工程 求调剂 +7 xiiiia 2026-03-04 7/350 2026-03-05 09:49 by 热情沙漠
[考研] 材料328求调剂 +10 一个萝卜02 2026-03-03 10/500 2026-03-05 09:31 by oxidpl
[考研] 0703化学 学硕 理工科均可 不区分研究方向 总分279求调剂 +7 1一11 2026-03-03 7/350 2026-03-05 09:23 by xwxstudy
[考研] 0856材料与化工,270求调剂 +17 YXCT 2026-03-01 20/1000 2026-03-05 09:22 by 一切OK
[考研] 376求调剂 +3 王浩然sam 2026-03-04 3/150 2026-03-05 07:48 by bxbo
[考研] 0703 总分319求调剂 +4 Xinyuu 2026-03-02 4/200 2026-03-03 22:58 by 让我们一起快乐
[考研] 化学0703求调剂 学硕 理/工科均可 总分279 +3 1一11 2026-03-03 5/250 2026-03-03 12:37 by 1一11
[考研] 295求调剂。一志愿报考郑州大学化学工艺学硕,总分295分 +8 yl1 2026-03-02 9/450 2026-03-02 21:21 by sunny81
[考研] 275求调剂 +3 L-xin? 2026-03-01 6/300 2026-03-02 10:22 by 热情沙漠
信息提示
请填处理意见