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hongkaichen

金虫 (小有名气)

[交流] 如何检测蛋白在大肠杆菌中的不表达是因为mRNA的不稳定?

RT   如何检测蛋白在大肠杆菌中的不表达是因为mRNA的不稳定?
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lifefamily


hongkaichen(金币+1,VIP+0):谢谢回答,这是老师的一个作业,跟实验无关. 5-13 12:55
有怎么一说?
不表达的因素多了:
细胞毒性,N端信号肽,稀有密码子,等等。
你换GST或者Trx融合试过了么?
2楼2009-05-13 10:23:30
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hongkaichen

金虫 (小有名气)

这是老师的一个作业,思考题,跟实验无关,因为mRNA不稳定也可能造成蛋白不表达,所以如果是这种原因,就是让我们用什么方法验证是不是这种原因。开始我觉得可以用观察多聚核糖体现象来验证,但这种方法不能排除菌自身的蛋白表达也能产生这种现象。如果用RT-PCR  P出来了不知道能不能说有mRNA存在,然后排除掉这种原因?
3楼2009-05-13 13:01:09
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lifefamily

真的,我还第一次听说跟mRNA不稳定有关,孤陋寡闻了……
三、mRNA稳定性与翻译控制
mRNA稳定性主要取决于3’—UTR结构
1.poly(A)尾增加mRNA稳定性,
2.3’-UTR中UA序列导致mRNA不稳定.


高手帮我扫盲一下!?

[ Last edited by lifefamily on 2009-5-13 at 15:09 ]
4楼2009-05-13 15:06:50
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hongkaichen

金虫 (小有名气)

在大肠杆菌中表达可能就没有polyA修饰,mRNA不稳定我觉得可能就是半衰期短,不能及时翻译。
5楼2009-05-13 15:21:12
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lifefamily

关键是,大肠杆菌是如此成熟的一个表达系统,为何就你这个蛋白的mRNA没有polyA修饰呢?
6楼2009-05-13 15:38:55
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hongkaichen

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by lifefamily at 2009-5-13 15:38:
关键是,大肠杆菌是如此成熟的一个表达系统,为何就你这个蛋白的mRNA没有polyA修饰呢?

这个我不知道怎么回答你,在大肠杆菌里确实有一小段polyA,如果PolyA酶突变了,或其他与ployA形成有关的蛋白突变了导致PolyA不能形成,这样导致mRNA不稳定也可能。其实我想问的重点是假如是mRNA不稳定的话,有什么方法可以检测?如果你要说不可能是mRNA不稳定照成的,那么你就设计一个实验来排除这种可能,理论还是需要实验来验证的。
7楼2009-05-13 16:10:56
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lifefamily

★ ★ ★ ★
hongkaichen(金币+4,VIP+0):谢谢讨论,我也没想到别的什么好方法了。 5-14 13:11
RT-PCR加Northern blot
其他想不到了。
8楼2009-05-14 08:50:45
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大海一孤舟

铜虫 (小有名气)

在原核生物中转录和翻译是同时进行的,就算是mRNA在不稳定也有一定的表达。如果真的要检测mRNA的稳定性,可以看看在细胞中的含量。
9楼2009-05-14 13:13:32
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rourou6199

银虫 (初入文坛)

好像可以加ActD或者Dox抑制转录后,分几个时间段提RNA做Northern看RNA降解没有
10楼2009-05-14 17:18:20
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