应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 怎样才能确定提取质粒 是我的目标基因？
51/1返回列表
查看: 1404  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

moretz

铜虫 (初入文坛)

[求助] 怎样才能确定提取质粒 是我的目标基因？ 已有1人参与

各位大神，求教！
从文献中查找了目标基因的前后引物，然后从生工合成引物后，对实验室中活性污泥的DNA进行扩增，跑胶 结果跑出了亮条带！
而后利用该泥样的DNA进行质粒提取——vector载体培养，固体培养基，蓝白菌挑菌，液体培养基，然后特异性引物跑胶（跑出了对应亮条带），纯化质粒后，
又送去生工对质粒进行测序，现在问题来了！
测序结果是 特殊结构，我怎样才能确定 我提的质粒 是我的目标基因呢？？ 如何比对？是使用blast吗？
非常感谢

快过年了 祝大家新年快乐阿
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2019-01-24 22:27:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

drwhoknowss

荣誉版主 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2019-02-13 20:37:18
特殊结构也能测序，你联系一下测序中心，用些特殊条件。然后再比对
赞一下 回复此楼
Progress in science depends on new techniques, new discoveries and new ideas, probably in that order. -- Nobel laureate Sydney Brenner
5楼2019-01-26 01:51:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

鲸鱼2016

新虫 (正式写手)
★
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2019-02-13 20:37:06
去掉载体片段后bast一下

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
2楼2019-01-24 22:42:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

moretz

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 鲸鱼2016 at 2019-01-24 22:42:14
去掉载体片段后bast一下

非常感谢！ 我用DNAstar的Seqman尝试去掉vector的序列，但是我去掉之后 Amplicon size为242， 但是我的目的基因的Amplicon size为197，我比对之后的确发现了我的目的基因，但是ident为81， 是不是我没有把载体序列去除干净阿？
您是怎么去掉载体片段的阿？~
再次感谢
赞一下 回复此楼
3楼2019-01-25 21:16:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

鲸鱼2016

新虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by moretz at 2019-01-25 21:16:25
非常感谢！ 我用DNAstar的Seqman尝试去掉vector的序列，但是我去掉之后 Amplicon size为242， 但是我的目的基因的Amplicon size为197，我比对之后的确发现了我的目的基因，但是ident为81， 是不是我没有把载体序列 ...

你可以和blast出来的序列比较一下看看，是不是两端不匹配造成的同源性差异，我用ncbi里面有一个vector 的工具，具体叫啥忘了，就在ncbi首页或blast拉到最下面的一堆工具里。

发自小木虫Android客户端
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2019-01-26 01:09:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料与化工一志愿南昌大学327求调剂推荐 +4 Ncdx123456 2026-03-13 5/250 2026-03-15 16:25 by Ncdx123456
[考研] 本人考085602 化学工程 专硕 +6 不知道叫什么！ 2026-03-15 7/350 2026-03-15 11:11 by peike
[考博] 欢迎申博同学联系 +3 天道酬勤2026686 2026-03-10 5/250 2026-03-14 23:19 by 17520222914
[考研] 化学调剂0703 +6 啊我我的 2026-03-11 6/300 2026-03-14 22:24 by shangxh
[考研] 材料与化工 323 英一+数二+物化，一志愿：哈工大 本人本科双一流 +4 自由的_飞翔 2026-03-13 5/250 2026-03-14 19:39 by hmn_wj
[考研] 267一志愿南京工业大学0817化工求调剂 +5 SUICHILD 2026-03-12 5/250 2026-03-14 14:53 by jean5056
[考研] 070300化学求调剂 +6 扑风铃的猫 2026-03-08 11/550 2026-03-14 03:39 by JourneyLucky
[考研] 材料调剂 +5 xxxcm 2026-03-08 8/400 2026-03-14 03:33 by JourneyLucky
[考研] 2026考研调剂+本科延边大学+山东大学+生物化学与分子生物学+有项目经验 +3 ccdsscjy 2026-03-09 6/300 2026-03-14 02:14 by JourneyLucky
[考研] 考研材料与化工，求调剂 +8 戏精丹丹丹 2026-03-09 8/400 2026-03-14 01:14 by JourneyLucky
[考研] 0703求调剂 +7 jtyq001 2026-03-10 7/350 2026-03-14 01:06 by JourneyLucky
[考研] 332求调剂 +3 zjy101327 2026-03-11 6/300 2026-03-13 22:48 by JourneyLucky
[考研] 求调剂（材料与化工327） +4 爱吃香菜啦 2026-03-11 4/200 2026-03-13 22:11 by JourneyLucky
[考研] ［0860］321分求调剂，ab区皆可 +4 宝贵热 2026-03-13 4/200 2026-03-13 22:01 by 星空星月
[考研] 土木第一志愿276求调剂，科研和技能十分丰富，求新兴方向的导师收留 +3 土木小天才 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:01 by JourneyLucky
[考研] 0856化学工程280分求调剂 +4 shenzxsn 2026-03-11 4/200 2026-03-13 11:55 by ymwdoctor
[考研] 0856化工原理 +6 z2839474511 2026-03-10 6/300 2026-03-13 10:41 by houyaoxu
[考研] 341求调剂 +4 捣蛋猪猪 2026-03-11 4/200 2026-03-12 14:47 by ruiyingmiao
[考研] 求调剂材料专硕293 +6 段_(:з」∠)_ 2026-03-10 6/300 2026-03-10 18:22 by ms629
[考研] 一志愿：武汉理工，材料工程，英二数二 总分314 +3 2202020125 2026-03-10 4/200 2026-03-10 13:54 by xiongyaxuan
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭