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bay__gulf金虫 (著名写手)
刘苏州
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bay__gulf
金虫 (著名写手)
刘苏州
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gwdavid(金币+5,VIP+0):牛！ 9-15 21:38
gwdavid(金币+5,VIP+0):牛！ 9-15 21:38
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vmd 远非能看到的那些菜单那么简单，可以点点鼠标就能完成。它内嵌有一个tcl 语言的解释器，可以用流程控制的方式完成几乎所有操作，这是vmd 的精华。 对于你的问题，如果文件按顺序为foo1.xyz, foo2.xyz, ... foo200.xyz，可以编写如下脚本 for { set i 1 } {$i <= 200 } {incr i} { set molid [ mol load xyz foo$i.xyz ] render snapshot foo$i.bmp mol delete $molid } 这样就可以批量生成foo1.bmp, ..., foo200.bmp 文件了 再用视频编辑程序把bmp 做成视频就可以了 你先试一下上面的， 视角，颜色，分辨率等也可以在脚本中指定，这可以在视频做出来后再添加 我也常去mdbbs ，用的就是那个用户名，在那里复杂namd 和vmd 这一块 |
73楼2009-09-08 18:50:40
2楼2009-05-02 11:58:42
bay__gulf
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lei0736(金币+4,VIP+0):谢谢 又添猛将 5-3 16:09
lei0736(金币+4,VIP+0):谢谢 又添猛将 5-3 16:09
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【回2楼】 可以，比如下面这篇文献 Bryan J. Johnson, Jordi Cohen, Richard W. Welford, Arwen R. Pearson, Klaus Schulten, Judith P. Klinman, and Carrie M. Wilmot. Exploring molecular oxygen pathways in Hanseluna Polymorpha copper-containing amine oxidase. Journal of Biological Chemistry, 282:17767-17776, 2007. [ Last edited by bay__gulf on 2009-5-2 at 13:21 ] |
3楼2009-05-02 13:13:06
4楼2009-05-02 13:45:28