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bay__gulf金虫 (著名写手)
刘苏州
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chcwaaa
木虫 (正式写手)
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连接2个pdb
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你好,我有2个pdb文件,我想用tcl命令连接到一个pdb里去. 我找到如下语句: protein.psf 和protein.pdb 对应 membrane.psf 和membrane.pdb对应 protein_lipids 是合并后的结果 package require psfgen readpsf protein.psf readpsf membrane.psf coordpdb protein.pdb coordpdb membrane.pdb writepdb protein_lipids.pdb writepsf protein_lipids.psf 我按照上面的脚本测试,出错:unable to add (duplicate?) residue W1:1. 我实际上是连接2个同样的水盒子,只是第二个相对于第一个盒子在z方向偏移了一定距离. 不知道是怎么回事,还有其它的方法吗? 非常感谢! |
101楼2009-11-03 21:14:12
2楼2009-05-02 11:58:42
bay__gulf
金虫 (著名写手)
刘苏州
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lei0736(金币+4,VIP+0):谢谢 又添猛将 5-3 16:09
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【回2楼】 可以，比如下面这篇文献 Bryan J. Johnson, Jordi Cohen, Richard W. Welford, Arwen R. Pearson, Klaus Schulten, Judith P. Klinman, and Carrie M. Wilmot. Exploring molecular oxygen pathways in Hanseluna Polymorpha copper-containing amine oxidase. Journal of Biological Chemistry, 282:17767-17776, 2007. [ Last edited by bay__gulf on 2009-5-2 at 13:21 ] |
3楼2009-05-02 13:13:06
4楼2009-05-02 13:45:28
