应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » pair_style hybrid/overlay指令用法
311/1返回列表
查看: 3807  |  回复: 30
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

2009云飞扬

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] pair_style hybrid/overlay指令用法

各位大神关于pair_style hybrid/overlay指令用法小弟有点不是太明白，能否详细说说呢？如这个例子
using, EAM, Tersoff and LJ for Fe-Fe,C-C and Fe-C interactions respectively. Fe is atom type 1, C is atom type 2.
pair_style hybrid eam/fs lj/cut 10.0 tersoff
pair_coeff * * eam/fs ../potentials/Fe_mm.eam.fs Fe NULL
pair_coeff 1 2 lj/cut 0.00759200 3.5 9.7625
pair_coeff * * tersoff ../potentials/Si.tersoff NULL Si
它包含了三个势函数类型，两种原子类型Fe、C， 在系数设置上面，第一条 ** 不是代表所有原子的相互作用吗？而原本是想铁铁的作用势选用EAM势，铁碳作用势力用的是LJ对势，这个我能看懂，可是最后一条不是太懂。“NULL”是代表缺省吗?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2018-12-26 18:44:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

19861226ya

木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
2009云飞扬(金币+1): 谢谢参与
2009云飞扬: 金币+10, 很有帮助，谢谢 2018-12-30 14:01:14
NULL表示的意思是不对这个类型原子/分子施加那种类型的作用势，比如说你现在有两种类型原子，Fe的原子序号是1，C的原子序号是2。在分配作用势的时候比如只是对于C的作用势时就必须忽略Fe。

发自小木虫Android客户端
赞一下(1人) 回复此楼
12楼2018-12-27 10:28:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

2009云飞扬

铁杆木虫 (著名写手)
请大家指点指点吧

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
6楼2018-12-26 22:41:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cumt2010meng

木虫 (著名写手)
★
2009云飞扬(金币+1): 谢谢参与
我是来领金币的～当然首先要送上祝福啦～～

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
8楼2018-12-27 04:04:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liuqiang68

至尊木虫 (文坛精英)
★
2009云飞扬(金币+1): 谢谢参与
加油！
回复此楼
10楼2018-12-27 06:14:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Nater1ver

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
2009云飞扬(金币+1): 谢谢参与
2009云飞扬: 金币+10, 很有帮助，谢谢 2018-12-30 14:01:01
随便简单说一说。势函数文件自己打开看一下就知道，是一个索引，你引用的元素名是文件里面引的，而in文件中，但凡要定义和使用这种势函数，必须遍历in文件中使用的所有原子种类，因此会出现 pair_xxx ** xxx.eam type1 type2 type3 type4这种定义方法(type1到type4表示每种原子在势函数索引中对应的名称，并不代表原子自己，即使type1是氟，你完全可以在这里填上氯，用氯原子的势函数来计算，即使这种操作是不正常的)，你可以看到，它是按照type顺序声明的。即使有的原子没有这种势函数的相互作用，这些原子也要包含进去(这显然与常见的势函数比如lj不同，lj中只用定义参与相互作用的原子类型)，当然假如没有参与相互作用就用NULL代替了，表示不参与作用

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

2009云飞扬
11楼2018-12-27 09:18:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

2009云飞扬

铁杆木虫 (著名写手)
送红花一朵
引用回帖:
11楼: Originally posted by Nater1ver at 2018-12-27 09:18:05
随便简单说一说。势函数文件自己打开看一下就知道，是一个索引，你引用的元素名是文件里面引的，而in文件中，但凡要定义和使用这种势函数，必须遍历in文件中使用的所有原子种类，因此会出现 pair_xxx ** xxx.eam ty ...

谢谢朋友 在咨询咨询，hybrid/overlay我理解的是把几个作用势集合起来，在咨询咨询“pair_xxx ** xxx.eam type1 type2 type3 type4”我原来理解的是在eam势函数文件里面，包含的原子种类，就是后面的type1-4。比如Fe_mm.eam.fs ，这个势函数里面就只有铁的势函数，因而写成pair_coeff 1 1 eam/fs ../potentials/Fe_mm.eam.fs Fe  （铁在in文件中代表原子类型为1），。你的意思是说in文件里面假如有两种原子类型，则在定义势函数系数的时候，都必须遍历取值，因而在这条指令pair_coeff * * eam/fs ../potentials/Fe_mm.eam.fs Fe NULL 是** 表示in文件中原子类型（铁 、碳）所有原子都参与了（铁铁、铁碳、碳碳三种作用势都采用Fe_mm.eam.fs 势函数，但是事实上它只是铁铁的势函数，而我们又只需要表示铁铁的作用势力，因而后面type类型中标注为Fe NULL ，“NULL ”的作用就是表示碳原子没有参与到这个势函数作用）。不知道我理解的是否正确，请你指点指点，实在是有点迷糊 了。
赞一下 回复此楼
13楼2018-12-27 16:27:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pl911

禁虫 (小有名气)
★
2009云飞扬(金币+1): 谢谢参与
本帖内容被屏蔽
29楼2020-01-03 15:51:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pl958

禁虫 (小有名气)
★
2009云飞扬(金币+1): 谢谢参与
本帖内容被屏蔽
30楼2020-01-06 11:40:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pl937

禁虫 (小有名气)
★
2009云飞扬(金币+1): 谢谢参与
本帖内容被屏蔽
31楼2020-01-09 16:08:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
youngen2楼
2018-12-26 19:16   回复  
2009云飞扬(金币+1): 谢谢参与
tzynew3楼
2018-12-26 19:42   回复  
2009云飞扬(金币+1): 谢谢参与
dongmings4楼
2018-12-26 19:52   回复  
2009云飞扬(金币+1): 谢谢参与
发自小木虫IOS客户端
slytjiaofei5楼
2018-12-26 22:24   回复  
2009云飞扬(金币+1): 谢谢参与
psylhh7楼
2018-12-26 22:51   回复  
2009云飞扬(金币+1): 谢谢参与
xiaoqiuqiu209楼
2018-12-27 05:11   回复  
2009云飞扬(金币+1): 谢谢参与
syhorchid14楼
2018-12-27 16:56   回复  
2009云飞扬(金币+1): 谢谢参与
nono200915楼
2018-12-27 21:03   回复  
2009云飞扬(金币+1): 谢谢参与
·
Biotage16楼
2018-12-27 23:13   回复  
2009云飞扬(金币+1): 谢谢参与
baowahao17楼
2018-12-27 23:19   回复  
2009云飞扬(金币+1): 谢谢参与
sz_kebaoyuan18楼
2018-12-27 23:20   回复  
2009云飞扬(金币+1): 谢谢参与
syhorchid19楼
2018-12-27 23:57   回复  
miaojiabing20楼
2018-12-28 08:30   回复  
2009云飞扬(金币+1): 谢谢参与
miaojiabing21楼
2018-12-29 08:29   回复  
youngen22楼
2018-12-31 13:04   回复  
xhmaohan23楼
2018-12-31 13:24   回复  
2009云飞扬(金币+1): 谢谢参与
发自小木虫Android客户端
slytjiaofei24楼
2018-12-31 15:30   回复  
guanlianwu25楼
2019-01-01 17:08   回复  
2009云飞扬(金币+1): 谢谢参与
xautldhldh26楼
2019-01-02 14:30   回复  
2009云飞扬(金币+1): 谢谢参与
瑞驰雨林27楼
2019-07-27 20:17   回复  
doublerobust28楼
2019-12-31 09:45   回复  
2009云飞扬(金币+1): 谢谢参与
发自小木虫IOS客户端
相关版块跳转 我要订阅楼主 2009云飞扬 的主题更新
311/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 269电子信息求调剂，可转专业 +6 独酌wl 2026-04-06 6/300 2026-04-09 17:33 by wp06
[论文投稿] 求助文献原文 10+3 18500821399 2026-04-08 3/150 2026-04-09 16:56 by 北京莱茵润色
[考研] 求调剂，262机械专硕 +6 嗯yyl 2026-04-08 6/300 2026-04-09 12:01 by zhouyuwinner
[考研] 302分求调剂 +4 凡语祈愿 2026-04-08 5/250 2026-04-08 22:03 by 土木硕士招生
[考研] 一志愿211，化学310分，本科重点双非，求调剂 +13 努力奋斗112 2026-04-08 13/650 2026-04-08 21:17 by 学员tURuqU
[考研] 本科211，293分请求调剂 +12 莲菜就是藕吧 2026-04-03 13/650 2026-04-08 20:30 by 背对大海出发
[考研] 298求调剂 +4 manman511 2026-04-05 4/200 2026-04-08 16:50 by tjzhao
[考研] 327求调剂 +12 Xxjc1107. 2026-04-06 12/600 2026-04-08 16:46 by luoyongfeng
[考研] 生物医药调剂｜SCI中科院三区一作+多项科研成果 +8 likangxing 2026-04-07 11/550 2026-04-08 00:02 by lys0704
[考研] 305分求调剂 +3 哈_哈_哈_哈_哈 2026-04-04 5/250 2026-04-07 14:49 by 哈_哈_哈_哈_哈
[考研] 工科 22408 267求推荐 +4 wanwan00 2026-04-05 5/250 2026-04-06 22:47 by chenzhimin
[考研] 0855求调剂材料 +11 红桃灼灼 2026-04-04 12/600 2026-04-06 10:26 by 蓝云思雨
[考研] 材料与化工371求调剂 +14 陪琳看海 2026-04-04 15/750 2026-04-06 06:59 by houyaoxu
[考研] 调剂 +3 李广火 2026-04-05 3/150 2026-04-05 18:57 by 蓝云思雨
[考研] 材料专硕(0856) 339分求调剂 +10 哈哈哈鹅哈哈哈 2026-04-04 10/500 2026-04-05 18:51 by 蓝云思雨
[考研] 341求调剂 +3 学无止境，冲 2026-04-05 3/150 2026-04-05 09:40 by lbsjt
[考研] 085602调剂 初试总分335 +12 19123253302 2026-04-04 12/600 2026-04-05 08:08 by 544594351
[考研] 化工求调剂 +11 荔香芝士椰奶 2026-04-03 11/550 2026-04-03 22:06 by 啵啵啵0119
[考研] 286求调剂 +8 lim0922 2026-04-02 8/400 2026-04-03 20:19 by rzh123456
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +6 崔wj 2026-04-02 6/300 2026-04-03 10:19 by 蓝云思雨
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭