| 查看: 3727 | 回复: 30 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[交流]
pair_style hybrid/overlay指令用法
|
|||
|
各位大神关于pair_style hybrid/overlay指令用法小弟有点不是太明白，能否详细说说呢？如这个例子 using, EAM, Tersoff and LJ for Fe-Fe,C-C and Fe-C interactions respectively. Fe is atom type 1, C is atom type 2. pair_style hybrid eam/fs lj/cut 10.0 tersoff pair_coeff * * eam/fs ../potentials/Fe_mm.eam.fs Fe NULL pair_coeff 1 2 lj/cut 0.00759200 3.5 9.7625 pair_coeff * * tersoff ../potentials/Si.tersoff NULL Si 它包含了三个势函数类型，两种原子类型Fe、C， 在系数设置上面，第一条 ** 不是代表所有原子的相互作用吗？而原本是想铁铁的作用势选用EAM势，铁碳作用势力用的是LJ对势，这个我能看懂，可是最后一条不是太懂。“NULL”是代表缺省吗? |
回复此楼» 猜你喜欢
考研求调剂
已经有4人回复
-
085601专硕，总分342求调剂，地区不限
已经有4人回复
-
085601材料工程专硕求调剂
已经有5人回复
-
一志愿天津大学化学工艺专业（081702）315分求调剂
已经有6人回复
-
能源材料化学课题组招收硕士研究生8-10名
已经有6人回复
-
296求调剂
已经有5人回复
-
0703化学调剂 ，六级已过，有科研经历
已经有8人回复
-
268求调剂
已经有8人回复
-
材料，纺织，生物（0856、0710），化学招生啦
已经有7人回复
-
301求调剂
已经有5人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
青岛高校2026招生硕士研究生
+5/905
-
南京医科大学生殖医学与子代健康国重实验室-董飞宏课题组-学术硕士招生
+1/97
-
天津理工大学国家杰青王铁课题组招收2026年博士研究生
+1/90
-
湘潭大学化工学院国家级人才团队2026年博士研究生招生
+1/67
-
山东师范大学有机化学专业胡忠燕老师课题组招收2026届硕士研究生以及调剂生
+1/40
-
催化方向推荐一个极好的博导
+1/38
-
1
+1/37
-
天津工业大学航空航天博士招生
+1/35
-
澳大利亚西澳大学（UWA）张金强课题组招收全奖博士生（化工新能源方向）
+1/32
-
2026年工科硕士调剂-上海大学全国重点实验室团队-材料数据挖掘方向-研究生3-5人
+1/30
-
欢迎交流咨询
+1/28
-
海南师范大学孙元元老师招生博士，名额1~2个，2026年9月份入学（光电/光热催化方向）
+1/18
-
国家级领军人才团队高分子材料方向2026年博士研究生招生
+1/16
-
【2026博士招生/博后招聘】北京航空航天大学潘彪课题组——AI芯片设计方向
+1/11
-
英国埃克塞特大学 & 法国巴黎萨克雷大学联合培养博士
+1/7
-
中国民航飞行学院先进连接团队招收航空宇航、航空机械专业硕士研究生（学硕专硕均可）
+1/7
-
26年博士招生
+1/6
-
南方科技大学生命科学学院基础免疫与微生物学系招收博士后
+1/4
-
博后即将出站，求稳定的教职
+1/4
-
急！招收北京工业大学与国家纳米科学中心联合培养博士1名，物理、材料、化学背景
+1/1
送红花一朵 |
谢谢朋友 在咨询咨询，hybrid/overlay我理解的是把几个作用势集合起来，在咨询咨询“pair_xxx ** xxx.eam type1 type2 type3 type4”我原来理解的是在eam势函数文件里面，包含的原子种类，就是后面的type1-4。比如Fe_mm.eam.fs ，这个势函数里面就只有铁的势函数，因而写成pair_coeff 1 1 eam/fs ../potentials/Fe_mm.eam.fs Fe （铁在in文件中代表原子类型为1），。你的意思是说in文件里面假如有两种原子类型，则在定义势函数系数的时候，都必须遍历取值，因而在这条指令pair_coeff * * eam/fs ../potentials/Fe_mm.eam.fs Fe NULL 是** 表示in文件中原子类型（铁 、碳）所有原子都参与了（铁铁、铁碳、碳碳三种作用势都采用Fe_mm.eam.fs 势函数，但是事实上它只是铁铁的势函数，而我们又只需要表示铁铁的作用势力，因而后面type类型中标注为Fe NULL ，“NULL ”的作用就是表示碳原子没有参与到这个势函数作用）。不知道我理解的是否正确，请你指点指点，实在是有点迷糊 了。 |
13楼2018-12-27 16:27:25
6楼2018-12-26 22:41:13
8楼2018-12-27 04:04:16
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
2009云飞扬(金币+1): 谢谢参与
2009云飞扬: 金币+10, 很有帮助，谢谢 2018-12-30 14:01:01
2009云飞扬(金币+1): 谢谢参与
2009云飞扬: 金币+10, 很有帮助，谢谢 2018-12-30 14:01:01
|
随便简单说一说。势函数文件自己打开看一下就知道，是一个索引，你引用的元素名是文件里面引的，而in文件中，但凡要定义和使用这种势函数，必须遍历in文件中使用的所有原子种类，因此会出现 pair_xxx ** xxx.eam type1 type2 type3 type4这种定义方法(type1到type4表示每种原子在势函数索引中对应的名称，并不代表原子自己，即使type1是氟，你完全可以在这里填上氯，用氯原子的势函数来计算，即使这种操作是不正常的)，你可以看到，它是按照type顺序声明的。即使有的原子没有这种势函数的相互作用，这些原子也要包含进去(这显然与常见的势函数比如lj不同，lj中只用定义参与相互作用的原子类型)，当然假如没有参与相互作用就用NULL代替了，表示不参与作用 发自小木虫Android客户端 |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
11楼2018-12-27 09:18:05
简单回复
2018-12-26 19:52
回复
