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tq0ax1r

新虫 (初入文坛)

[交流] 目标蛋白82kDa纯化出来只有25kDa? 已有5人参与

大家好,我最近让其它学校帮忙构建了一个表达我想要的蛋白的质粒,该质粒先前就带有6Histag-MBP融合蛋白,然后我的蛋白序列是直接插入在MBP之后的,他们构建完后有发给我测序报告,序列正确,我也把质粒序列放在EXPASY-translate tool上测过读码框正确是我想要的 (6Histag-MBP-我的蛋白 = 82kDa)。可纯化完后只有一条很深的25kDa的条带,我想不通,6Histag-MBP的分子量是42kDa,也就是说把MBP融合蛋白中间切断的大小。

前几步洗镍柱没有25kDa这个条带,wash buffer最高用到40mM imidazole,最后elute蛋白的时候用了500mM imidazole才出现这个25kDa的条带,那也就是说它应该是带有不少histidine的,否则自然界带Histidine很少的蛋白早就被洗下来了,基于此点我觉得读码框移位的可能性不大。想来想去裂解的时候用的是tip sonicator,虽然我中间有让E.coli冷却一下再继续,会不会还是因为power太高把蛋白降解了呢?我加了PMSF,冰上超声的。另外,跑SDSPAGE的时候,用的sample buffer里含有巯基乙醇,这个会影响吗?难道会切断MBP融合蛋白?如果是降解了,估计是断裂成很多片段了,因为前几步洗柱没有看到很显眼的某个条带。

请教各位有经验的大神,一般遇到这种情况,你们碰到的最大的可能性是什么?是蛋白讲解,还是说最后纯化出来的25kD的条带根本就是个杂蛋白?只听说过融合蛋白和目标蛋白中间断裂的,没见过融合蛋白自己中间断裂的
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鲸鱼2016

新虫 (正式写手)

★ ★
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西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2018-12-24 12:49:01
过会不会蛋白没表达?空载的大小在蛋白胶上有一定偏差?楼主裂解菌体后有没有制样跑胶

发自小木虫Android客户端
2楼2018-12-21 06:58:38
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tq0ax1r

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 鲸鱼2016 at 2018-12-21 06:58:38
过会不会蛋白没表达?空载的大小在蛋白胶上有一定偏差?楼主裂解菌体后有没有制样跑胶

有这可能,没表达,可能25kDa是个杂蛋白,其它条带几乎看不出特别明显的表达
3楼2018-12-22 06:38:46
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鲸鱼2016

新虫 (正式写手)

★
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引用回帖:
3楼: Originally posted by tq0ax1r at 2018-12-22 06:38:46
有这可能,没表达,可能25kDa是个杂蛋白,其它条带几乎看不出特别明显的表达...

得先确认表达才能纯化,楼主加油

发自小木虫Android客户端
4楼2018-12-22 06:47:35
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yubeihong

铁杆木虫 (职业作家)


5楼2018-12-26 20:29:07
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w.hallo

铜虫 (小有名气)

★
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可以试试Rosetta大肠杆菌试一试

发自小木虫IOS客户端
6楼2018-12-26 23:12:35
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tq0ax1r

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by w.hallo at 2018-12-26 23:12:35
可以试试Rosetta大肠杆菌试一试

我用的就是Rosetta
7楼2018-12-27 02:35:15
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许苏南

禁虫 (初入文坛)

★
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本帖内容被屏蔽

8楼2018-12-27 10:35:40
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applefav

新虫 (著名写手)

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
可能是杂蛋白吧,没有表达的可能性比较大,建议先确认是否表达吧; MBP tag为什么不用Amylose beads纯化?那个比Ni柱干净。

发自小木虫Android客户端
9楼2018-12-27 11:01:27
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