| 查看: 1269 | 回复: 5 | |||
没尾巴的猴子铁虫 (小有名气)
|
[求助]
用AMBER做的MD模拟后，如何判断是否处于同一个稳态？
|
| 对接出来的复合物，动力学模拟后，做了好几条副本，算的结合能值相差很大；这种情况应该怎么解决啊？困扰好久了 |
回复此楼» 猜你喜欢
有多少人是今天查系统知道结果的？
已经有19人回复
-
国社科又开始会评了，不知道这次命运如何
已经有9人回复
-
能否申诉？
已经有5人回复
-
为什么到现在没收到通知？
已经有5人回复
-
有没有仍没收到信息的
已经有8人回复
-
售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急
已经有5人回复
-
售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急
已经有4人回复
-
售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有5人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急
已经有4人回复
ltl_1988
至尊木虫 (著名写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 16594.5
- 散金: 100
- 红花: 11
- 帖子: 2454
- 在线: 122.6小时
- 虫号: 1717784
- 注册: 2012-03-26
- 专业: 药物设计与药物信息
2楼2018-12-15 00:07:12
没尾巴的猴子
铁虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 250.1
- 散金: 50
- 帖子: 109
- 在线: 41小时
- 虫号: 5580274
- 注册: 2017-02-15
- 性别: MM
- 专业: 药物设计与药物信息
|
模拟时长应该是够的，应该是我起始结构的问题，模拟至稳态时，每段轨迹都处于不同的稳定状态，重新对接可能也是同样的结果，老师给我的意见是做聚类分析，找出最优聚类里势能最低作为起始结构，但是，貌似这个方法也不行，不知道还有什么方法能解决？ 发自小木虫IOS客户端 |
3楼2018-12-17 20:21:25
ltl_1988
至尊木虫 (著名写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 16594.5
- 散金: 100
- 红花: 11
- 帖子: 2454
- 在线: 122.6小时
- 虫号: 1717784
- 注册: 2012-03-26
- 专业: 药物设计与药物信息
4楼2018-12-18 01:40:22
没尾巴的猴子
铁虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 250.1
- 散金: 50
- 帖子: 109
- 在线: 41小时
- 虫号: 5580274
- 注册: 2017-02-15
- 性别: MM
- 专业: 药物设计与药物信息
5楼2018-12-18 14:16:46
研究生王大锤
新虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 731.4
- 散金: 38
- 沙发: 1
- 帖子: 459
- 在线: 41.1小时
- 虫号: 5841802
- 注册: 2017-03-05
- 性别: GG
- 专业: 药物化学
6楼2019-01-05 17:03:27
30