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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【讨论】关于从头设计的筛选工作
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fantastic

银虫 (著名写手)

[交流] 【讨论】关于从头设计的筛选工作

我用从头设计根据软件生成了几千个小分子，受体结构已知，不可能像平常做dock那样做dock吧。大家说说有什么有效的办法来挑选呢？有谁做过相关的工作，拿出来晒晒，不胜感激

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-24 at 21:53 ]
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1楼 2009-04-19 22:31:00
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fantastic

银虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by wuhanhgf2002 at 2009-4-20 08:03:
你是用什么软件做的从头设计？怎么会产生这么多的小分子？你用的是片段生长法，还是片段连接法？

我用的是北大的一个软件ligbuilder，是片段生长法
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3楼2009-04-21 08:38:00
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wuhanhgf2002

金虫 (正式写手)
★
zeoliters(金币+1,VIP+0):感谢回复！ 5-26 13:41
你是用什么软件做的从头设计？怎么会产生这么多的小分子？你用的是片段生长法，还是片段连接法？
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2楼2009-04-20 08:03:57
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wuhanhgf2002

金虫 (正式写手)
★
mingdong(金币+1,VIP+0):感谢交流！ 6-16 07:28
这个软件没有相应的打分吗？你可以结合相应的打分来挑选，也可以尝试用ludi来做。
赞一下(10人) 回复此楼
4楼2009-04-22 08:06:09
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xuxm03

金虫 (小有名气)
★
zeoliters(金币+1,VIP+0):感谢回复！ 5-26 13:42
引用回帖:
Originally posted by fantastic at 2009-4-19 22:31:
我用从头设计根据软件生成了几千个小分子，受体结构已知，不可能像平常做dock那样做dock吧。大家说说有什么有效的办法来挑选呢？有谁做过相关的工作，拿出来晒晒，不胜感激

用X-score 打一下分吧
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5楼2009-04-29 09:25:57
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