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[交流]
【讨论】关于从头设计的筛选工作
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我用从头设计根据软件生成了几千个小分子，受体结构已知，不可能像平常做dock那样做dock吧。大家说说有什么有效的办法来挑选呢？有谁做过相关的工作，拿出来晒晒，不胜感激 [ Last edited by lei0736 on 2009-11-24 at 21:53 ] |
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7楼2009-06-15 08:26:15
q68(金币+0,VIP+0):怎么解决的，分享一下经验！ 6-16 15:37
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谢谢大家的关注了，问题我已经解决了，呵呵 有机会再和大家交流！ ———————————————————————— 其实我刚开始的时候以为从头设计的分子都应该先用dock6做一遍筛选，后来听一个师兄讲，dock只是适合大规模虚拟筛选的，结果不准确，后来我就舍弃了dock，改直接用autodock，采用autodocktools下面的python脚本来准备文件，类似于用autodock做虚拟筛选。 另外从头设计软件里面也有一些对于分子的评价参数，也可作为挑选的依据。 [ Last edited by fantastic on 2009-6-17 at 19:24 ] |
8楼2009-06-16 15:33:12
