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【讨论】关于从头设计的筛选工作
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我用从头设计根据软件生成了几千个小分子,受体结构已知,不可能像平常做dock那样做dock吧。大家说说有什么有效的办法来挑选呢?有谁做过相关的工作,拿出来晒晒,不胜感激 [ Last edited by lei0736 on 2009-11-24 at 21:53 ] |
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q68(金币+0,VIP+0):怎么解决的,分享一下经验! 6-16 15:37
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谢谢大家的关注了,问题我已经解决了,呵呵 有机会再和大家交流! ———————————————————————— 其实我刚开始的时候以为从头设计的分子都应该先用dock6做一遍筛选,后来听一个师兄讲,dock只是适合大规模虚拟筛选的,结果不准确,后来我就舍弃了dock,改直接用autodock,采用autodocktools下面的python脚本来准备文件,类似于用autodock做虚拟筛选。 另外从头设计软件里面也有一些对于分子的评价参数,也可作为挑选的依据。 [ Last edited by fantastic on 2009-6-17 at 19:24 ] |
8楼2009-06-16 15:33:12












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