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weizhi111

至尊木虫 (正式写手)

[求助] COIP实验求教 已有1人参与

做两个蛋白在体内互作co-IP实验,A能拉下B,但B拉不下A,是怎么回事呢?

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weizhi111

至尊木虫 (正式写手)

2楼2018-11-05 07:57:37
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梅雪芳

新虫 (小有名气)

同样在做COIP,个人认为你只要一个方向拉下来就行了吧?反方向会不会是因为B所结合的其他蛋白成分比较多,掩盖了A成分?

我们这边想做某个杂蛋白ESP与细胞中的蛋白DNMT/TET的相互作用,想知道这个杂蛋白ESP中的哪些成分能与细胞中的蛋白DNMT/TET相互作用,用COIP-MS的方法。
      目前的做法是,做了杂蛋白ESP的多克隆抗体(兔IgG),买了蛋白DNMT/TET的商品化抗体。将杂蛋白ESP与细胞作用48h后,做coip。洗脱后,用杂蛋白ESP的多克隆抗体做WB验证,发现没有特异性条带,也就是没拉下来,但是其他的实验又间接证明他们之间应该有关系。
   
请问这种情况会是什么问题呢?原代细胞?杂蛋白多抗的问题?蛋白与细胞作用时间太长了?
    还是说根本就没有结合?
    这种情况有没有什么解决方案,或者应该用什么方法验证一下呢?
    以下是两次COIP的结果,没有看到特异性条带
3楼2018-11-19 22:57:38
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幽幽深谷竹

金虫 (著名写手)

骨子里是文科男的理科男

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
weizhi111: 金币+8, ★★★很有帮助 2018-12-13 08:34:49
这个其实很常见的。最好的结果是互相都能拉下来。然而实际情况是正调可以,反调不行。这可能是因为两个蛋白表达丰度不同,导致拉下来蛋白的能力不同。建议最好做过表达后的COIP,或者COip之后打质谱做分析,这样更准确
我就是我IamwhatIam
4楼2018-12-12 22:05:13
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prthefu

木虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 幽幽深谷竹 at 2018-12-12 22:05:13
这个其实很常见的。最好的结果是互相都能拉下来。然而实际情况是正调可以,反调不行。这可能是因为两个蛋白表达丰度不同,导致拉下来蛋白的能力不同。建议最好做过表达后的COIP,或者COip之后打质谱做分析,这样更准 ...

想问一下,如果要拉下来的蛋白是未知的,那打质谱后,怎么分析是哪个蛋白呢?质谱结果分析,是不是挺难得啊,后面我也要做coip,检测的是未知蛋白。
nothing is impossible in this world,if you have the will to win,you can achieve anything
5楼2019-01-03 11:21:58
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