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Mimo1993

新虫 (初入文坛)

[求助] 二代测序OneMismactchRate很高,可能是什么原因啊?

如题,测序质控数据OneMismactchRate达到了40,是样本的问题还是其他什么原因呢?
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Mimo1993

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 在水壹方 at 2018-10-29 18:13:06
也就是错配率,和测序以及序列的结构都可能有关,重复片段比较高的话,错配率明显会升高

同批次其他样本下机是正常的,只有这个很高,一般来说十几都是比较高的吧……
3楼2018-10-30 10:49:28
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在水壹方

新虫 (小有名气)

也就是错配率,和测序以及序列的结构都可能有关,重复片段比较高的话,错配率明显会升高

发自小木虫Android客户端
2楼2018-10-29 18:13:06
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在水壹方

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by Mimo1993 at 2018-10-30 10:49:28
同批次其他样本下机是正常的,只有这个很高,一般来说十几都是比较高的吧……...

很高了,一般在0.1%

发自小木虫Android客户端
4楼2018-10-30 23:45:46
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