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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 二代测序OneMismactchRate很高，可能是什么原因啊？
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Mimo1993

新虫 (初入文坛)

[求助] 二代测序OneMismactchRate很高，可能是什么原因啊？

如题，测序质控数据OneMismactchRate达到了40，是样本的问题还是其他什么原因呢？
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1楼 2018-10-29 17:11:14
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在水壹方

新虫 (小有名气)
也就是错配率，和测序以及序列的结构都可能有关，重复片段比较高的话，错配率明显会升高

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2楼2018-10-29 18:13:06
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Mimo1993

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 在水壹方 at 2018-10-29 18:13:06
也就是错配率，和测序以及序列的结构都可能有关，重复片段比较高的话，错配率明显会升高

同批次其他样本下机是正常的，只有这个很高，一般来说十几都是比较高的吧……
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3楼2018-10-30 10:49:28
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在水壹方

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by Mimo1993 at 2018-10-30 10:49:28
同批次其他样本下机是正常的，只有这个很高，一般来说十几都是比较高的吧……...

很高了，一般在0.1%

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4楼2018-10-30 23:45:46
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