24小时热门版块排行榜    

查看: 3188  |  回复: 14
【奖励】 本帖被评价9次,作者beikwx增加金币 7.2
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

beikwx

木虫 (小有名气)


[资源] Sail_Vina 1.0正式版发布(Vina虚拟筛选/反向对接图形界面)

1.0.1更新:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=12635205

=====================================================

再次感谢@cewinhot对bug的反馈~~

1.0版本经过自己和一些朋友的测试,大致已经没有什么bug,如果有欢迎继续反馈~,更新日志:

1.现在参数全部可以保留,不会重启就删除啦~
2.内置prepare_ligand4,不用再为路径而烦恼
3.新增auto box选项,参考文献方法:
Feinstein WP, Brylinski M. (2015) Calculating an optimal box size for ligand docking and virtual screening against experimental and predicted binding pockets. J Cheminform 7 (1): 18.
文献说可以提高对接效率和准度,自己测试了下感觉还不错。
Sail_Vina 1.0正式版发布(Vina虚拟筛选/反向对接图形界面)

如果使用有问题可以通过邮箱联系:
studyforever0225@gmail.com

务必瞟一下教程

之后的话打算添加几个功能,看之后有没有时间,如果有什么想法可以说,我看看能不能加入进去。
1.柔性受体对接:目前对接方案受体都是刚性的,不过已经满足大部分需求了。
2.分子生成器:指定R基团,替换成各种药物常见基团用于虚拟筛选。

还是再次感谢@cewinhot
回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:libolin3@tal.com
  • 附件 1 : Sail_Vina_v1.0(32位).zip
  • 2018-08-29 21:43:15, 8.83 M
  • 附件 2 : Sail_Vina_v1.0(64位).zip
  • 2018-08-29 21:43:16, 8.69 M
  • 附件 3 : SailVina_tutorial.txt
  • 2018-08-29 21:44:54, 7.73 K

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

木狼人耶

新虫 (小有名气)


12楼2020-05-28 00:02:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 15 个回答

冷血孤峰

银虫 (小有名气)


11楼2020-05-21 00:57:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
liumangtu9楼
2019-10-02 14:42   回复  
五星好评  顶一下,感谢分享!
wph6667楼
2019-07-29 22:30   回复  
五星好评  顶一下,感谢分享!
wph6668楼
2019-07-29 22:31   回复  
顶一下,感谢分享!
2768952772楼
2018-09-03 17:32   回复  
五星好评  顶一下,感谢分享!
wan773楼
2018-09-10 16:29   回复  
meh。。5楼
2018-10-14 13:20   回复  
五星好评  顶一下,感谢分享!
聆籁子10楼
2020-01-25 21:40   回复  
五星好评  顶一下,感谢分享!
h_lk13楼
2020-07-17 10:18   回复  
送红花一朵
发自小木虫IOS客户端
☆ 无星级 ★ 一星级 ★★★ 三星级 ★★★★★ 五星级
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 面上项目代表作必须有通讯作者文章吗? +21 zlxnnx111 2024-05-09 32/1600 2024-05-11 23:15 by sakuraai
[论文投稿] 投稿竟然倒在了Scientific Reports上。 +7 lizhengke06 2024-05-10 7/350 2024-05-11 20:53 by feng6531
[硕博家园] 矿大本-中科大硕(推免)-24年科研助理求职-方向不限 +8 Kelaizhang 2024-05-08 16/800 2024-05-11 19:58 by Kelaizhang
[考博] 一篇一作AM,寻求西安985博导 +6 LYWwrz 2024-05-06 7/350 2024-05-11 19:37 by 东昌莘
[基金申请] E05送审了么? +5 wly78528 2024-05-08 5/250 2024-05-11 18:54 by 小博shine
[考博] 上海大学2024年秋季博士招生 +6 94872300 2024-05-08 9/450 2024-05-11 15:26 by 丶非乐
[硕博家园] 科研不是打打杀杀,科研就是人情世故 +10 杞天大圣 2024-05-08 10/500 2024-05-11 09:05 by 贪吃fish
[基金申请] 十个本子来自一个高校,六个本子来自一个导师的学生 +18 babu2015 2024-05-10 19/950 2024-05-11 08:27 by 持之以恒j
[硕博家园] 盲审 +13 暮色恋伊人 2024-05-07 15/750 2024-05-10 21:28 by 暮色恋伊人
[基金申请] 函评这一关首先干掉一大半,今年卷上天了 (金币+5) +26 mycaas 2024-05-07 36/1800 2024-05-10 17:22 by 降温器
[有机交流] 酰胺合成 +6 Spiralup 2024-05-06 11/550 2024-05-10 10:10 by Spiralup
[基金申请] 是不是面上基金获得资助最多限三项,大家怎么看 +20 bailu929 2024-05-07 21/1050 2024-05-09 20:15 by 星火12
[教师之家] 请问有没有想要联合培养学生的老师? +3 吴小懒 2024-05-08 4/200 2024-05-09 15:35 by ou0551
[有机交流] 胺醛缩合实验问题求助 20+3 坏蛋不叫鸟 2024-05-05 11/550 2024-05-09 12:14 by 坏蛋不叫鸟
[电化学] 水系电池正极制作 +3 shangfujun 2024-05-09 3/150 2024-05-09 12:03 by jacky601
[硕博家园] 学术会议PPT +10 Ken_Hu 2024-05-07 10/500 2024-05-09 07:41 by 诸葛莫莫
[访问学者] NUS Bala教授招CSC联培 +4 山高水远来日方 2024-05-07 5/250 2024-05-08 20:33 by lucas1553
[基金申请] 想问下,F口信息的函评是不是还没开始? +3 wowhow 2024-05-07 5/250 2024-05-08 12:31 by cuicyge
[教师之家] 请教下各位,南京航空航天大学天目湖校区如何? +3 pp爱写论文 2024-05-05 5/250 2024-05-07 16:48 by 似水流年Youth
[基金申请] 基金函评开始了吗 +5 fuzy 2024-05-05 5/250 2024-05-06 11:57 by hdzw9071
信息提示
请填处理意见