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beikwx

木虫 (小有名气)


[资源] Sail_Vina 1.0正式版发布(Vina虚拟筛选/反向对接图形界面)

1.0.1更新:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=12635205

=====================================================

再次感谢@cewinhot对bug的反馈~~

1.0版本经过自己和一些朋友的测试,大致已经没有什么bug,如果有欢迎继续反馈~,更新日志:

1.现在参数全部可以保留,不会重启就删除啦~
2.内置prepare_ligand4,不用再为路径而烦恼
3.新增auto box选项,参考文献方法:
Feinstein WP, Brylinski M. (2015) Calculating an optimal box size for ligand docking and virtual screening against experimental and predicted binding pockets. J Cheminform 7 (1): 18.
文献说可以提高对接效率和准度,自己测试了下感觉还不错。
Sail_Vina 1.0正式版发布(Vina虚拟筛选/反向对接图形界面)

如果使用有问题可以通过邮箱联系:
studyforever0225@gmail.com

务必瞟一下教程

之后的话打算添加几个功能,看之后有没有时间,如果有什么想法可以说,我看看能不能加入进去。
1.柔性受体对接:目前对接方案受体都是刚性的,不过已经满足大部分需求了。
2.分子生成器:指定R基团,替换成各种药物常见基团用于虚拟筛选。

还是再次感谢@cewinhot
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  • 附件 1 : Sail_Vina_v1.0(32位).zip
  • 2018-08-29 21:43:15, 8.83 M
  • 附件 2 : Sail_Vina_v1.0(64位).zip
  • 2018-08-29 21:43:16, 8.69 M
  • 附件 3 : SailVina_tutorial.txt
  • 2018-08-29 21:44:54, 7.73 K

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