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求助大家啊,Overlap pcr连接不上
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yuevis
铜虫
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1楼
2018-08-27 12:49:57
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xmcsxq0606
新虫
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虫号: 3489065
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
弥散很可能是片段GC富集,或者引物3'端GC富集。你这重叠30bp足够,我们都用15bp
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10楼
2018-08-28 20:45:37
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yuevis
铜虫
(小有名气)
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(幼儿园)
金币: 6.3
帖子: 281
在线: 74小时
虫号: 4994662
我做四个片段连在一起,先把中间两个overlap连上了,接近1000bp,剩下两个片段都接近500bp,这三个片段分别pcr都能扩增出来,但是overlap怎么都连不上,我用的是phanta酶,扩增总是从在很大的条带(大于2000bp)处开始弥散涂带,我用taq酶做overlap的话,在1000处有个弱条带,剩下也是弥散涂带。三个片段重叠区有30bp,Tm68度左右,68度试过,从68度往下降落也试过,也试过两步分开先不加引物,之后再加,以及开始就加引物的方法,都没有效果。之前怀疑是不是退火温度的问题导致没连上,可是几个温度都试了。求助各位给点意见。
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3楼
2018-08-27 12:50:05
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yuevis
铜虫
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求求各位,给点意见啊
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7楼
2018-08-27 12:57:15
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Tc148
新虫
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虫号: 4594741
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
试试俩俩overlap
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8楼
2018-08-27 14:45:56
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zxthx
6楼
2018-08-27 12:51
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hdchina2010
5楼
2018-08-27 12:50
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yuevis(金币+2): 谢谢参与
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andrewhf
4楼
2018-08-27 12:50
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yuevis(金币+4): 谢谢参与
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坏山药
2楼
2018-08-27 12:50
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yuevis(金币+3): 谢谢参与
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