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引物设计的问题 已有7人参与
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1.我要通过普通PCR扩增一个2000bp的目的基因，将这个基因序列导入到Primer 5里设计引物，引物设计出来之后显示产物长度（product size）只有262bp，但是我需要的序列大小是2000bp，这样设计出来的引物是不是错的，正确的应该要如何设计才能扩增出这个基因。 2.在查找目的基因序列时，我通过基因名在NCBI上查到了该基因的序列，显示的是mRNA,complete cds，师兄告诉我要将NCBI中该基因的信息最下方的Origin处的序列提取出来，然后与小麦参考基因组进行比对，将比对后得到的序列作为该基因的源序列进行引物设计，这样的流程是规范的吗？还是说可以直接利用NCBI上查到的序列进行引物设计。 实验新手，麻烦各位大神帮我详细解答一下，谢谢大家啦 |
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2楼2018-07-28 08:41:48
Charles-glh 
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elmanbio
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xie45518
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5楼2018-07-31 13:52:17
忽悠小混混
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在softberry上，分析一下基因结构，有无内含子，无内含子就可以用基因组扩，在基因两段设计引物，如果有内含子，就用cDNA扩，在CDS两端设计引物 发自小木虫Android客户端 |
6楼2018-08-01 00:18:28
7楼2018-08-01 08:41:56
8楼2018-08-01 08:52:54
忽悠小混混
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9楼2018-08-01 11:45:53
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10楼2018-12-17 22:39:02