| 查看: 1033 | 回复: 5 | |||
| 当前主题已经存档。 | |||
| 【有奖交流】积极回复本帖子,参与交流,就有机会分得作者 wuhanhgf2002 的 4 个金币 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
wuhanhgf2002金虫 (正式写手)
|
[交流]
【求助】关于gromacs的重启以及延长模拟时间
|
||
|
请教个问题,我用gmx跑动力学到20ns,我想再接着跑10ns,于是我用了 tpbconv -s md1.tpr -f md1.trr -e md1.edr -extend 10000 -o md2.tpr mdrun -v -s md2.tpr -o md2.trr -c md2.gro -e md2.edr -g md2.log 但是发现新的md2.log文件中的时间从0ps开始计时,这是什么原因啊? 我的gmx如果中途由于停电断掉,我想接着上一步继续跑的时候也会遇到同样的问题: tpbconv -s md1.tpr -f md1.trr -e md1.edr -o md2.tpr mdrun -v -s md2.tpr -o md2.trr -c md2.gro -e md2.edr -g md2.log 所以我就不清楚gromacs在继续跑的时候是不是考虑了上一步的时间和速度。恳求高人指点,万分感谢! [ Last edited by lei0736 on 2009-11-13 at 21:41 ] |
» 猜你喜欢
售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急
已经有3人回复
浙江师范大学是怎么坑我的
已经有7人回复
求教各位大神:2026教育部人文社科青年基金项目何时公示呀?
已经有6人回复
面上有专家说实验设备不是我们单位的
已经有8人回复
科研求助
已经有4人回复
博士去二本高校当辅导员,如何调整心态?
已经有11人回复
江苏省自然基金 什么时候出结果
已经有6人回复
闲聊
已经有3人回复
wuhanhgf2002
金虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 323.8
- 帖子: 435
- 在线: 43.1小时
- 虫号: 121302
- 注册: 2005-12-03
- 性别: GG
- 专业: 有机合成
3楼2009-03-30 17:38:42
xuefei06
木虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 贵宾: 0.18
- 金币: 1957.8
- 红花: 1
- 帖子: 303
- 在线: 384.4小时
- 虫号: 424222
- 注册: 2007-07-21
- 性别: GG
- 专业: 高分子物理与高分子物理化
2楼2009-03-30 12:53:56
wuhanhgf2002
金虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 323.8
- 帖子: 435
- 在线: 43.1小时
- 虫号: 121302
- 注册: 2005-12-03
- 性别: GG
- 专业: 有机合成
4楼2009-03-31 08:23:56
wuhanhgf2002
金虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 323.8
- 帖子: 435
- 在线: 43.1小时
- 虫号: 121302
- 注册: 2005-12-03
- 性别: GG
- 专业: 有机合成
5楼2009-04-01 08:05:20









回复此楼