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[交流]
【求助】关于gromacs的重启以及延长模拟时间
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请教个问题,我用gmx跑动力学到20ns,我想再接着跑10ns,于是我用了 tpbconv -s md1.tpr -f md1.trr -e md1.edr -extend 10000 -o md2.tpr mdrun -v -s md2.tpr -o md2.trr -c md2.gro -e md2.edr -g md2.log 但是发现新的md2.log文件中的时间从0ps开始计时,这是什么原因啊? 我的gmx如果中途由于停电断掉,我想接着上一步继续跑的时候也会遇到同样的问题: tpbconv -s md1.tpr -f md1.trr -e md1.edr -o md2.tpr mdrun -v -s md2.tpr -o md2.trr -c md2.gro -e md2.edr -g md2.log 所以我就不清楚gromacs在继续跑的时候是不是考虑了上一步的时间和速度。恳求高人指点,万分感谢! [ Last edited by lei0736 on 2009-11-13 at 21:41 ] |
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