| 查看: 915 | 回复: 5 | |||
| 当前主题已经存档。 | |||
| 【有奖交流】积极回复本帖子，参与交流，就有机会分得作者 wuhanhgf2002 的 4 个金币 | |||
wuhanhgf2002金虫 (正式写手)
|
[交流]
【求助】关于gromacs的重启以及延长模拟时间
|
||
|
请教个问题，我用gmx跑动力学到20ns，我想再接着跑10ns，于是我用了 tpbconv -s md1.tpr -f md1.trr -e md1.edr -extend 10000 -o md2.tpr mdrun -v -s md2.tpr -o md2.trr -c md2.gro -e md2.edr -g md2.log 但是发现新的md2.log文件中的时间从0ps开始计时，这是什么原因啊？ 我的gmx如果中途由于停电断掉，我想接着上一步继续跑的时候也会遇到同样的问题： tpbconv -s md1.tpr -f md1.trr -e md1.edr -o md2.tpr mdrun -v -s md2.tpr -o md2.trr -c md2.gro -e md2.edr -g md2.log 所以我就不清楚gromacs在继续跑的时候是不是考虑了上一步的时间和速度。恳求高人指点，万分感谢！ [ Last edited by lei0736 on 2009-11-13 at 21:41 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
267一志愿南京工业大学0817化工求调剂
已经有7人回复
-
一志愿华中科技大学，080502，354分求调剂
已经有3人回复
-
一志愿中国海洋大学，生物学，301分，求调剂
已经有4人回复
-
一志愿武理材料305分求调剂
已经有6人回复
-
材料专硕英一数二306
已经有3人回复
-
085600材料与化工调剂 324分
已经有7人回复
-
311求调剂
已经有3人回复
-
26调剂/材料/英一数二/总分289/已过A区线
已经有7人回复
-
295求调剂
已经有5人回复
-
354求调剂
已经有5人回复
xuefei06
木虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 贵宾: 0.18
- 金币: 1957.8
- 红花: 1
- 帖子: 303
- 在线: 384.4小时
- 虫号: 424222
- 注册: 2007-07-21
- 性别: GG
- 专业: 高分子物理与高分子物理化
2楼2009-03-30 12:53:56
wuhanhgf2002
金虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 323.8
- 帖子: 435
- 在线: 43.1小时
- 虫号: 121302
- 注册: 2005-12-03
- 性别: GG
- 专业: 有机合成
3楼2009-03-30 17:38:42
wuhanhgf2002
金虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 323.8
- 帖子: 435
- 在线: 43.1小时
- 虫号: 121302
- 注册: 2005-12-03
- 性别: GG
- 专业: 有机合成
4楼2009-03-31 08:23:56
wuhanhgf2002
金虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 323.8
- 帖子: 435
- 在线: 43.1小时
- 虫号: 121302
- 注册: 2005-12-03
- 性别: GG
- 专业: 有机合成
5楼2009-04-01 08:05:20
6楼2009-04-01 20:36:01
5