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lren_87

铁杆木虫 (正式写手)

傻子乐

[求助] TA克隆,验证总不对已有1人参与

非常简单的实验,耽误了很久,一直都不对。

细菌16S片段,插入pMD-18t载体,连接转化完了后凃平板,挑取单菌落进行PCR验证,用的M13F和M13R的引物验证,要么PCR验证失败,要么PCR结果出现1-2条带,都非常亮,但是都大于2000bp,实际M13F和M13R间的序列+16S的序列应该是在1700bp左右。

后来直接把重组质粒提取出来,然后送测序,结果全部都不成功,测了10多次,要么套峰,要么直接信号弱。

这个问题怎么破???这么简单的实验,耽误了几个月了,求大佬伸出援手。
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大浪淘沙
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呆呆戴戴

新虫 (著名写手)

引物特异性不好 pcr产物不纯 可以切胶回收目的片段大小附近的凝胶 回收后进行二次PCR

发自小木虫IOS客户端
2楼2018-06-30 12:27:53
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lren_87

铁杆木虫 (正式写手)

傻子乐

引用回帖:
2楼: Originally posted by 呆呆戴戴 at 2018-06-30 12:27:53
引物特异性不好 pcr产物不纯 可以切胶回收目的片段大小附近的凝胶 回收后进行二次PCR

插入片段已经是纯化过了的
大浪淘沙
3楼2018-06-30 12:35:47
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petty04

新虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
drwhoknowss: 金币+3, 鼓励交流 2018-07-02 01:37:05
换个不同抗性的载体试试;换个靠谱的cloning kit,推荐Invitrogen的 TOPO TA cloning kit;另外,感受态确定是好的?不确定的话重新制备感受态细胞。TA克隆很简单,把每一步不确定是否有问题的东西都换掉,肯定能解决。
4楼2018-07-01 13:27:51
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