应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 核酸杂交 » 10几个碱基杂交能不能用PAGE电泳跑出来？
101/1返回列表
查看: 1679  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

meng199102

新虫 (小有名气)

[求助] 10几个碱基杂交能不能用PAGE电泳跑出来？ 已有2人参与

最近跑胶跑到怀疑人生了。现求助万能的虫友，我的实验如下：
两条单链分别是30和60个碱基，但是只有连续12个碱基是互补的，我想通过电泳证明他们确实杂交了。目前试过10-20%的非变性PAGE胶和琼脂糖胶了，退火后室温静置2-3小时，loading dye 都跑出来，也没有显示出杂交带。有没有小伙伴有相关经验求告知，求分享啊！
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2018-06-27 08:15:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

petty04

新虫 (职业作家)
★ ★
渊博震天: 金币+2, 鼓励积极回帖交流 2018-06-27 08:39:39
4℃跑胶，低电压长时间跑，胶里要加Mg离子，应该可以跑出杂交条带

发自小木虫Android客户端
赞一下(1人) 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

meng199102 meng199102
2楼2018-06-27 08:33:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

张青峰

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
meng199102: 金币+15, ★有帮助 2018-06-27 23:19:57
感觉有难度，12个碱基Tm值是多少？两条链有没有二级结构？如果两条单链自身形成的二级结构Tm较高，很难形成双链。
也只能试试了，像二楼说的加Mg2+。
赞一下(1人) 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

meng199102
3楼2018-06-27 10:24:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

meng199102

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by petty04 at 2018-06-27 08:33:22
4℃跑胶，低电压长时间跑，胶里要加Mg离子，应该可以跑出杂交条带

谢谢你的建议！有试过100 v跑2小时， 没试过低温跑。试过杂交的时候加Mg，请问胶里加Mg是防止跑胶的时候解链吗?
赞一下 回复此楼
4楼2018-06-27 23:06:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

meng199102

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by 张青峰 at 2018-06-27 10:24:27
感觉有难度，12个碱基Tm值是多少？两条链有没有二级结构？如果两条单链自身形成的二级结构Tm较高，很难形成双链。
也只能试试了，像二楼说的加Mg2+。

非常感谢！还真没想过Tm的问题，其中有一条链有二级结构。只能先试试低温加Mg跑了。之前还有看到文献说用变性PAGE胶跑的，到时候都试试。
赞一下 回复此楼
5楼2018-06-27 23:19:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

meng199102

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by petty04 at 2018-06-27 08:33:22
4℃跑胶，低电压长时间跑，胶里要加Mg离子，应该可以跑出杂交条带

按你说的试了，果然能跑开。再次感谢
赞一下 回复此楼
6楼2018-06-29 03:20:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lapt

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
meng199102: 金币+10, ★★★很有帮助 2018-07-04 02:11:08
镁离子可以稳定双链的形成，建议跑胶条件与反应条件保持一致，推荐用5mM镁离子以上，都可以试试
赞一下 回复此楼
7楼2018-07-03 16:19:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

meng199102

新虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by lapt at 2018-07-03 16:19:28
镁离子可以稳定双链的形成，建议跑胶条件与反应条件保持一致，推荐用5mM镁离子以上，都可以试试

谢谢！不过我一直试到20 mM 镁离子才有效果，我看别人基本10mM就能行，不知道是不是有什么其他问题
赞一下 回复此楼
8楼2018-07-04 02:12:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lapt

木虫 (正式写手)
你可以使用IDT网站计算双链杂交的反应焓变，模拟杂交，看是不是反应本身的问题。

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
9楼2018-07-05 09:31:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

雨后春笋！

银虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by lapt at 2018-07-05 09:31:46
你可以使用IDT网站计算双链杂交的反应焓变，模拟杂交，看是不是反应本身的问题。

你好，我想问一下那个IDT网站怎么用的，我不知道怎么计算两条杂交链的反应焓变，求指教

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
10楼2018-09-14 11:56:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 meng199102 的主题更新
101/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 l7k6xnh0yc 2026-05-14 3/150 2026-05-15 12:03 by onwj4wpxp2
[基金申请] 精华III:  评审感受-评审感受-评审感受 +14 ferrarichen 2026-05-11 18/900 2026-05-15 11:12 by cmhchen
[基金申请] 这年头没有找到涵评专家，还有中面上的可能吗 +9 dd921ww 2026-05-12 10/500 2026-05-15 10:41 by muyiliuhui
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 l7k6xnh0yc 2026-05-14 3/150 2026-05-15 09:23 by onwj4wpxp2
[基金申请] 青C资助名额大幅增加！ +10 西葫芦炒鸡蛋 2026-05-13 14/700 2026-05-15 09:07 by gy116024
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 cjf4bx70cj 2026-05-14 4/200 2026-05-15 09:03 by gagyerk94e
[文学芳草园] 风把牡丹吹跑了 +4 myrtle 2026-05-12 7/350 2026-05-14 23:58 by myrtle
[教师之家] 教学课件你会给同学吗 +8 硕士研究生吗 2026-05-13 8/400 2026-05-14 22:23 by 常规沥青
[考博] 26应届毕业生考博求助 +3 wo一定上岸 2026-05-13 3/150 2026-05-14 21:47 by 明海天涯
[基金申请] 重磅！青年科学基金项目（C类）资助增幅预计超过50% +5 水和泥不是水泥 2026-05-13 7/350 2026-05-14 20:57 by 水和泥不是水泥
[有机交流] 求助2，4-二氯-5-嘧啶甲醛的合成方法 20+3 光吃不拉 2026-05-14 5/250 2026-05-14 20:15 by 一切都是空工
[高分子] 本人最近太闲了，谁有问题可以提，每天会统一回复 +8 一切都是空工 2026-05-12 19/950 2026-05-14 20:03 by 一切都是空工
[考博] 申博自荐 +4 食品的橙子 2026-05-09 6/300 2026-05-14 16:05 by great1919
[考博] 材料类只有一篇综述能申博么 +4 乐逍遥谷 2026-05-13 4/200 2026-05-14 12:05 by zhyzzh
[基金申请] 请问大佬b0816评完了吗 +3 市民华南虎 2026-05-12 7/350 2026-05-14 07:41 by 市民华南虎
[论文投稿] 有带发论文的吗 +3 山楂之术 2026-05-09 3/150 2026-05-13 17:56 by Cyhcl2629
[硕博家园] 导师各种操作恶心咋办 +11 苍白的小青天 2026-05-09 13/650 2026-05-13 17:11 by 六两废铜
[论文投稿] 求助大佬sci投稿哪个好中 +3 江沅188 2026-05-12 4/200 2026-05-13 14:35 by 江沅188
[考博] 西南大学考核制博士 +3 lijunjie84 2026-05-11 6/300 2026-05-12 18:09 by lijunjie84
[文学芳草园] 窗边初夏的小雨 +7 阿美_Lml888 2026-05-09 10/500 2026-05-12 15:27 by 阿美_Lml888
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭