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求助数据的处理,对照组为1时,对照组的标准偏差为啥不是0? 已有1人参与
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| RT-PCR处理数据,柱状图中,用倍数表示各处理组与对照组关系时,对照组数值为1,但为何还有标准偏差?想知道具体原理和处理过程,望各位大佬不吝赐教!十分感谢! |
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4楼2018-05-16 23:53:48

2楼2018-05-16 20:31:53
用户晓晓
木虫 (正式写手)
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【答案】应助回帖
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感谢参与,应助指数 +1
浮生若惊梦: 金币+30, ★★★★★最佳答案, 讲得很好! 2018-05-16 23:53:15
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对照组的1其实是归一化而来的,不是一个真实的表达量,而且是由对照组中的N个个体重复共同决定的,同样是一个平均值,肯定也有标准差,那这个标准差反应的就是对照组的组内差异! 具体的计算:fold change这种计算的核心思想就是计算-ddCT时要减去对照组的平均值,这样导致对照组都是每个个体减去自己的平均值,那么对照组的-ddCT的平均值是0,那么2-0次方的值就是1。所以最终的结果对照组平均值就是1,其他组是根据对照组计算而来,其实就是与对照组的比值,所以这种思想叫做fold change。 祝楼主实验顺利! |
3楼2018-05-16 23:05:59
用户晓晓
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西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2018-05-17 07:52:25
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2018-05-17 07:52:25
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其实我说的归一化也不准确,这种计算方法是相对定量,都是相对于内参基因的表达量,只是计算时都共同减了同一个数值(对照组平均值,或者所有组的平均值,或者最大值最小值都是OK的),所以具有了可比性。 发自小木虫Android客户端 |
5楼2018-05-17 00:05:32










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